17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2670 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  100 
 
 
791 aa  1588    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4024  hypothetical protein  19.84 
 
 
816 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220512  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  21.25 
 
 
806 aa  138  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4010  hypothetical protein  21.61 
 
 
832 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.865765  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  19.64 
 
 
1075 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  21.47 
 
 
812 aa  84  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1949  hypothetical protein  16.92 
 
 
802 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.618184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  20.66 
 
 
820 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  22.47 
 
 
911 aa  69.3  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  20.54 
 
 
867 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  19.89 
 
 
884 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  22.25 
 
 
1090 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  19.66 
 
 
892 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  18.26 
 
 
928 aa  53.5  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  20.24 
 
 
931 aa  53.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  23.23 
 
 
919 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  18.7 
 
 
1031 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>