30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2110 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  100 
 
 		 892 aa  1786    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  48.26 
 
 		 867 aa  808    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  38.25 
 
 		 884 aa  570  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  29.83 
 
 		 892 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  25.3 
 
 		 911 aa  290  9e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  22.64 
 
 		 928 aa  262  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  29.15 
 
 		 1038 aa  201  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  22.44 
 
 		 1031 aa  144  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  23.08 
 
 		 931 aa  134  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  24.67 
 
 		 919 aa  130  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  24.5 
 
 		 1090 aa  129  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  24.59 
 
 		 939 aa  129  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  21.99 
 
 		 1031 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  20.47 
 
 		 1027 aa  110  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  20.17 
 
 		 806 aa  104  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1949  hypothetical protein  20.05 
 
 		 802 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.618184 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  19.66 
 
 		 791 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  21.22 
 
 		 812 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  24.05 
 
 		 765 aa  51.6  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  24.05 
 
 		 765 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4010  hypothetical protein  20.19 
 
 		 832 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.865765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  18.95 
 
 		 1075 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  21.33 
 
 		 809 aa  48.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4024  hypothetical protein  18.57 
 
 		 816 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220512  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  31.36 
 
 		 820 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  21.23 
 
 		 686 aa  45.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1699 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  20.86 
 
 		 612 aa  44.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  23.42 
 
 		 611 aa  44.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  26.62 
 
 		 797 aa  44.3  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>