21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1548 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  48.12 
 
 		 931 aa  925    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  100 
 
 		 919 aa  1828    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  46.05 
 
 		 939 aa  821    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  40.28 
 
 		 1031 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  41.74 
 
 		 1027 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  31.87 
 
 		 1090 aa  364  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  26.45 
 
 		 1038 aa  316  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  28.87 
 
 		 1031 aa  283  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  26.84 
 
 		 892 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  24.66 
 
 		 884 aa  144  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  26.48 
 
 		 867 aa  136  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  24.67 
 
 		 892 aa  131  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  20.93 
 
 		 928 aa  118  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  23.08 
 
 		 911 aa  114  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  26.99 
 
 		 587 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  20.71 
 
 		 806 aa  55.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  22.67 
 
 		 677 aa  52.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  23.23 
 
 		 791 aa  52.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  21.76 
 
 		 812 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  26.21 
 
 		 820 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  19.6 
 
 		 1075 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>