24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1342 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  100 
 
 
820 aa  1650    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  44.1 
 
 
812 aa  644    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4024  hypothetical protein  32.02 
 
 
816 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220512  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4010  hypothetical protein  23.98 
 
 
832 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.865765  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  20.76 
 
 
791 aa  93.2  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  19.75 
 
 
806 aa  81.6  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  20.05 
 
 
892 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1949  hypothetical protein  17.55 
 
 
802 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.618184 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  26.11 
 
 
1038 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  27.72 
 
 
919 aa  54.3  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  31.33 
 
 
892 aa  52  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  25.73 
 
 
931 aa  52  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  22.88 
 
 
704 aa  50.8  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  22.79 
 
 
939 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  21.84 
 
 
1075 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  27.95 
 
 
884 aa  48.9  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1344  hypothetical protein  24.84 
 
 
776 aa  48.5  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  21.68 
 
 
867 aa  47.8  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  21.43 
 
 
1317 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  26.85 
 
 
1090 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  25 
 
 
911 aa  45.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  32.03 
 
 
1031 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1388  glycosyl transferase family 51  24.62 
 
 
759 aa  44.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319404  normal  0.452017 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  21.48 
 
 
862 aa  44.3  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>