40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3857 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  100 
 
 		 862 aa  1761    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  30.41 
 
 		 797 aa  68.9  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  28.93 
 
 		 587 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  24.29 
 
 		 1077 aa  57.8  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  24.24 
 
 		 606 aa  56.2  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  28.46 
 
 		 502 aa  54.7  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  28.46 
 
 		 508 aa  54.7  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  23.62 
 
 		 606 aa  54.3  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  27.36 
 
 		 1146 aa  53.5  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  23.24 
 
 		 606 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  23.24 
 
 		 606 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  26.28 
 
 		 732 aa  52.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  20.36 
 
 		 607 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  28.69 
 
 		 1275 aa  51.2  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  21.29 
 
 		 606 aa  51.2  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  19.76 
 
 		 607 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  19.77 
 
 		 607 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  24.26 
 
 		 695 aa  49.3  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  19.76 
 
 		 607 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1307 aa  48.5  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1344  hypothetical protein  22.22 
 
 		 776 aa  48.1  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159374 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  28.07 
 
 		 742 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  29.13 
 
 		 1239 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  21.13 
 
 		 640 aa  47.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  23.24 
 
 		 695 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  26.02 
 
 		 1061 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1238 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  24.68 
 
 		 646 aa  45.8  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1234 aa  46.2  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1428 aa  46.2  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  27.68 
 
 		 709 aa  45.8  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4318  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1268 aa  45.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.939284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  22.47 
 
 		 1079 aa  45.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  20.86 
 
 		 606 aa  45.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  28 
 
 		 1247 aa  44.7  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  26.5 
 
 		 725 aa  44.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  23.31 
 
 		 812 aa  44.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  28 
 
 		 1247 aa  44.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  28.03 
 
 		 642 aa  44.3  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  27.27 
 
 		 701 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>