125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2162 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  100 
 
 		 701 aa  1382    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  32.47 
 
 		 711 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  28.18 
 
 		 699 aa  187  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  26.39 
 
 		 725 aa  178  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  24.68 
 
 		 712 aa  144  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  22.96 
 
 		 812 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  22.7 
 
 		 794 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  22.55 
 
 		 732 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  22.93 
 
 		 606 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  24.96 
 
 		 606 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  23.91 
 
 		 606 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  24.96 
 
 		 606 aa  111  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  24.2 
 
 		 682 aa  110  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  23.8 
 
 		 750 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2178  AsmA family protein  24.06 
 
 		 695 aa  108  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  23.8 
 
 		 750 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  23.76 
 
 		 741 aa  106  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  21.91 
 
 		 740 aa  100  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  22.01 
 
 		 745 aa  100  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  24.93 
 
 		 797 aa  100  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  23.63 
 
 		 748 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  23.8 
 
 		 748 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  23.32 
 
 		 748 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  24.35 
 
 		 742 aa  95.1  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  24.82 
 
 		 604 aa  90.5  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  24.01 
 
 		 747 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  25.18 
 
 		 611 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  25.38 
 
 		 612 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  20.96 
 
 		 762 aa  81.6  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  24.88 
 
 		 606 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  23.16 
 
 		 654 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  22.13 
 
 		 893 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1095 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  22.21 
 
 		 655 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  27.78 
 
 		 607 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  27.78 
 
 		 607 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  23.37 
 
 		 709 aa  75.1  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  20.75 
 
 		 695 aa  74.3  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1955  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1070 aa  73.9  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  26.98 
 
 		 607 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  26.98 
 
 		 607 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  20.92 
 
 		 741 aa  71.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  21.79 
 
 		 656 aa  71.6  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  21.31 
 
 		 648 aa  70.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  26.11 
 
 		 609 aa  70.9  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  28.46 
 
 		 789 aa  70.1  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  22.88 
 
 		 696 aa  70.1  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  26.63 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  21.83 
 
 		 643 aa  69.7  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  25.61 
 
 		 608 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  26.23 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  25.11 
 
 		 606 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  23.02 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  24.03 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  24.14 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  19.92 
 
 		 703 aa  67  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  22.46 
 
 		 677 aa  67  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1428  hypothetical protein  22.24 
 
 		 711 aa  65.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  20.18 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  25.17 
 
 		 604 aa  64.3  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  22.24 
 
 		 649 aa  63.9  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  28.17 
 
 		 265 aa  63.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  28.97 
 
 		 1077 aa  63.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  26.49 
 
 		 705 aa  63.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  23.93 
 
 		 748 aa  62.4  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  20 
 
 		 611 aa  60.8  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  22.07 
 
 		 640 aa  60.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  25.32 
 
 		 826 aa  60.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  30.16 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  20.43 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  20 
 
 		 611 aa  57.8  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  21.83 
 
 		 741 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  25.98 
 
 		 599 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  29.41 
 
 		 741 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  28.21 
 
 		 818 aa  56.2  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  23.61 
 
 		 599 aa  56.6  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  28.64 
 
 		 646 aa  55.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  21.74 
 
 		 611 aa  55.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  22.81 
 
 		 618 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  22.81 
 
 		 618 aa  55.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  22.81 
 
 		 618 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  27.16 
 
 		 1191 aa  54.7  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  33.8 
 
 		 660 aa  54.7  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  22.16 
 
 		 640 aa  54.3  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  33.8 
 
 		 660 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  24.18 
 
 		 655 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  26.72 
 
 		 611 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  21.6 
 
 		 669 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  21.09 
 
 		 649 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  23.44 
 
 		 615 aa  52.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  26.8 
 
 		 677 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  23.81 
 
 		 649 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  28.68 
 
 		 632 aa  52  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  24.89 
 
 		 602 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  18.42 
 
 		 617 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  18.42 
 
 		 617 aa  51.2  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  18.42 
 
 		 617 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  18.42 
 
 		 617 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  18.42 
 
 		 617 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  18.42 
 
 		 617 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>