32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3274 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2027  AsmA  48.41 
 
 		 1273 aa  948    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  100 
 
 		 1239 aa  2341    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  48.83 
 
 		 1308 aa  977    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  50.12 
 
 		 1275 aa  1102    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  46.84 
 
 		 1274 aa  917    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  46.57 
 
 		 1258 aa  979    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  29.24 
 
 		 1331 aa  266  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1247 aa  154  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1246 aa  152  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1247 aa  151  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  23.35 
 
 		 1278 aa  146  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1238 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1230 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  23.03 
 
 		 1273 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  28.48 
 
 		 1186 aa  101  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1174 aa  99.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  24.22 
 
 		 1146 aa  97.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1210 aa  89.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1146 aa  85.1  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  26.17 
 
 		 742 aa  56.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  38.64 
 
 		 1175 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  38.64 
 
 		 1175 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  30.25 
 
 		 656 aa  52  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  26.27 
 
 		 862 aa  51.6  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1234 aa  51.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1179 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  25 
 
 		 794 aa  49.3  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  32.73 
 
 		 999 aa  47.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  26.23 
 
 		 667 aa  47.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  29.57 
 
 		 699 aa  45.8  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  23.08 
 
 		 812 aa  45.1  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  24.84 
 
 		 657 aa  45.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>