193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0159 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  100 
 
 		 794 aa  1564    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  29.75 
 
 		 812 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  29.39 
 
 		 797 aa  283  9e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  27.93 
 
 		 699 aa  227  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  26.38 
 
 		 748 aa  205  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  25.03 
 
 		 789 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  25.43 
 
 		 893 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  27.35 
 
 		 742 aa  195  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  24.85 
 
 		 750 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  24.42 
 
 		 750 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  25.49 
 
 		 741 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  25.25 
 
 		 732 aa  171  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  28.94 
 
 		 712 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  24.54 
 
 		 741 aa  163  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  24.01 
 
 		 741 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  23.41 
 
 		 740 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  22.55 
 
 		 701 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  24.49 
 
 		 695 aa  125  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  27.59 
 
 		 745 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  27.35 
 
 		 695 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  25.8 
 
 		 703 aa  120  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  24.92 
 
 		 748 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  26.13 
 
 		 748 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  24.79 
 
 		 747 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  29.75 
 
 		 725 aa  118  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  29.53 
 
 		 611 aa  119  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  25.94 
 
 		 748 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  27.95 
 
 		 607 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  28.47 
 
 		 508 aa  115  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  25.61 
 
 		 606 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  28.47 
 
 		 502 aa  115  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  25.22 
 
 		 696 aa  115  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  29.8 
 
 		 606 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  27.78 
 
 		 607 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  24.04 
 
 		 741 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  27.53 
 
 		 607 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  27.18 
 
 		 607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  27.37 
 
 		 711 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  24.18 
 
 		 682 aa  111  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  24.44 
 
 		 606 aa  109  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  27.72 
 
 		 606 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  26.15 
 
 		 606 aa  107  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  26.22 
 
 		 606 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  29.5 
 
 		 612 aa  106  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  27.67 
 
 		 604 aa  105  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  26.95 
 
 		 614 aa  104  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  22.46 
 
 		 826 aa  104  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  24.74 
 
 		 719 aa  103  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  26.33 
 
 		 614 aa  103  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  28.62 
 
 		 608 aa  103  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  23.5 
 
 		 640 aa  95.5  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  26.84 
 
 		 762 aa  95.1  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1095 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  31.27 
 
 		 1077 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  23.71 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  25.76 
 
 		 709 aa  77.4  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  22.76 
 
 		 506 aa  77  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  25.86 
 
 		 677 aa  76.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  21.65 
 
 		 617 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  25.44 
 
 		 688 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  21.53 
 
 		 617 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  22.73 
 
 		 618 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  21.53 
 
 		 617 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  27.38 
 
 		 611 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  25.44 
 
 		 688 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  22.4 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  21.82 
 
 		 617 aa  71.2  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  22.34 
 
 		 618 aa  70.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  22.31 
 
 		 618 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  21.13 
 
 		 617 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  22.47 
 
 		 618 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  27.18 
 
 		 678 aa  70.5  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  21.17 
 
 		 617 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  21.17 
 
 		 617 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  32.85 
 
 		 688 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  21.17 
 
 		 617 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  22.03 
 
 		 615 aa  69.3  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  22.08 
 
 		 618 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  29.2 
 
 		 832 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  29.2 
 
 		 839 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  27.93 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  29 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  23.1 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  35.94 
 
 		 688 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  28.5 
 
 		 599 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  30.89 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  25.13 
 
 		 688 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  20.99 
 
 		 617 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  21.49 
 
 		 645 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  30.11 
 
 		 609 aa  65.1  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  23.41 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  24.86 
 
 		 646 aa  63.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  25.34 
 
 		 675 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  36.28 
 
 		 688 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  37.07 
 
 		 667 aa  63.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  25.26 
 
 		 704 aa  63.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  26.61 
 
 		 660 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  25.52 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  25.2 
 
 		 765 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  25.2 
 
 		 765 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>