27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3363 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  56.91 
 
 		 1274 aa  1212    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  80.23 
 
 		 1273 aa  1633    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  52.26 
 
 		 1239 aa  944    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  100 
 
 		 1308 aa  2490    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  46.07 
 
 		 1275 aa  1048    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  48.46 
 
 		 1258 aa  982    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  33.76 
 
 		 1331 aa  202  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1246 aa  172  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1230 aa  138  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1234 aa  126  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  25.57 
 
 		 1186 aa  123  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1238 aa  122  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  23.01 
 
 		 1273 aa  120  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  24.71 
 
 		 1278 aa  103  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1247 aa  101  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1247 aa  100  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1146 aa  75.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  22 
 
 		 1146 aa  70.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1210 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  22.99 
 
 		 1077 aa  63.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  25.24 
 
 		 812 aa  49.7  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  37.66 
 
 		 1179 aa  48.9  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1175 aa  48.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1175 aa  48.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1174 aa  47.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  25.83 
 
 		 797 aa  46.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  26.28 
 
 		 651 aa  45.1  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>