33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0826 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  100 
 
 		 651 aa  1305    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  38.16 
 
 		 630 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  37.68 
 
 		 630 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  30.2 
 
 		 608 aa  253  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  26.84 
 
 		 645 aa  200  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  26.69 
 
 		 645 aa  194  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  25.95 
 
 		 649 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  26.28 
 
 		 603 aa  173  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  21.18 
 
 		 626 aa  100  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  26.71 
 
 		 655 aa  99.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  23.09 
 
 		 677 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  21.93 
 
 		 645 aa  93.6  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  22.31 
 
 		 643 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  22.42 
 
 		 656 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  27.8 
 
 		 580 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  20.88 
 
 		 648 aa  67.4  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  23.26 
 
 		 654 aa  67.8  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  21.2 
 
 		 649 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  20.37 
 
 		 642 aa  66.6  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  24.41 
 
 		 611 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  21.61 
 
 		 655 aa  60.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  22.43 
 
 		 634 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  20.74 
 
 		 654 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  23.59 
 
 		 632 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  28.57 
 
 		 1186 aa  52  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  23.34 
 
 		 632 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  25 
 
 		 1273 aa  51.2  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  20.49 
 
 		 709 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  28.85 
 
 		 1331 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  25.9 
 
 		 1077 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1246 aa  48.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  22.73 
 
 		 610 aa  46.6  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  18.64 
 
 		 1278 aa  44.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>