43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0167 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0167  AsmA  100 
 
 		 603 aa  1207    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  31.05 
 
 		 645 aa  280  5e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  30.76 
 
 		 649 aa  276  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  30.72 
 
 		 645 aa  274  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  27.05 
 
 		 630 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  29.6 
 
 		 608 aa  191  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  26.38 
 
 		 630 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  27.03 
 
 		 626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  26.62 
 
 		 651 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  23.21 
 
 		 654 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  22.54 
 
 		 655 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  23.14 
 
 		 643 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  23.82 
 
 		 649 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  23.71 
 
 		 645 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  21.93 
 
 		 656 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  26.58 
 
 		 655 aa  105  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  23.04 
 
 		 642 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  21.51 
 
 		 654 aa  103  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  26.82 
 
 		 634 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.92 
 
 		 709 aa  91.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  24.94 
 
 		 580 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  21.09 
 
 		 648 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  24.49 
 
 		 611 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  24.94 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  25.19 
 
 		 632 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  21.91 
 
 		 677 aa  77.4  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  22.7 
 
 		 646 aa  68.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  22.51 
 
 		 610 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  23.19 
 
 		 660 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  22.83 
 
 		 660 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  22.1 
 
 		 675 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  20.97 
 
 		 617 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  20.81 
 
 		 617 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  20.81 
 
 		 617 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  20.81 
 
 		 617 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  20.81 
 
 		 617 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  20.81 
 
 		 617 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  20.81 
 
 		 617 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  20.66 
 
 		 617 aa  47  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  21.39 
 
 		 656 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  20.6 
 
 		 617 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  21.34 
 
 		 1077 aa  45.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  20.3 
 
 		 657 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>