43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2918 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  98.1 
 
 		 632 aa  1186    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  100 
 
 		 632 aa  1209    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  86.86 
 
 		 634 aa  1001    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  42.77 
 
 		 610 aa  389  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  40.94 
 
 		 611 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  38.55 
 
 		 580 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  28.17 
 
 		 642 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  28.66 
 
 		 655 aa  150  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  28.19 
 
 		 656 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  27.85 
 
 		 645 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  26.97 
 
 		 655 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  26.98 
 
 		 643 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  27.93 
 
 		 648 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  28.09 
 
 		 654 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  29.21 
 
 		 649 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  27.55 
 
 		 654 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  24.28 
 
 		 649 aa  98.2  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  24.62 
 
 		 645 aa  96.3  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  24.19 
 
 		 645 aa  88.6  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  25.71 
 
 		 603 aa  86.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  21.01 
 
 		 626 aa  68.2  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  21.94 
 
 		 677 aa  64.7  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  25.67 
 
 		 608 aa  57.4  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  25.98 
 
 		 791 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  22.4 
 
 		 651 aa  54.3  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  23.14 
 
 		 630 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  26.9 
 
 		 660 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  28.69 
 
 		 611 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  23.51 
 
 		 1013 aa  50.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  26.58 
 
 		 660 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  21.95 
 
 		 630 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  28.39 
 
 		 599 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  20.95 
 
 		 709 aa  47.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  22.77 
 
 		 712 aa  47.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  24.25 
 
 		 832 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1247 aa  46.2  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1247 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  25.5 
 
 		 675 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  18.88 
 
 		 695 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  24.62 
 
 		 656 aa  44.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  27.11 
 
 		 1278 aa  44.3  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  23.88 
 
 		 839 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  26.62 
 
 		 745 aa  43.9  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>