81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3762 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  100 
 
 		 654 aa  1255    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  33.18 
 
 		 648 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  32.46 
 
 		 655 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  32.64 
 
 		 654 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  30.47 
 
 		 643 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  30.82 
 
 		 656 aa  265  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  31.55 
 
 		 645 aa  260  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  36.11 
 
 		 649 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  28.2 
 
 		 655 aa  190  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  25.61 
 
 		 642 aa  153  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  23.12 
 
 		 677 aa  123  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  27.81 
 
 		 634 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  23.62 
 
 		 649 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  28.73 
 
 		 660 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  27.68 
 
 		 675 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  23.53 
 
 		 645 aa  116  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  28.55 
 
 		 660 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  22.49 
 
 		 645 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  27.74 
 
 		 632 aa  110  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  23.21 
 
 		 709 aa  107  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  28.04 
 
 		 632 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  22.15 
 
 		 603 aa  97.4  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  29.41 
 
 		 610 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  26.16 
 
 		 611 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  26.08 
 
 		 656 aa  86.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  21 
 
 		 626 aa  85.1  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  28.81 
 
 		 580 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  29.46 
 
 		 1013 aa  84  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  23.3 
 
 		 630 aa  84  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  23.5 
 
 		 630 aa  82.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  23.94 
 
 		 602 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  29.59 
 
 		 599 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  22.6 
 
 		 649 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  23.62 
 
 		 640 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  27.45 
 
 		 826 aa  72.4  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  26.13 
 
 		 649 aa  72.4  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  23.3 
 
 		 712 aa  71.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  30.25 
 
 		 611 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  25.17 
 
 		 646 aa  68.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  23.26 
 
 		 651 aa  67.8  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  27.24 
 
 		 606 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  24.56 
 
 		 655 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  22.88 
 
 		 614 aa  65.1  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  22.02 
 
 		 705 aa  63.9  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  28.81 
 
 		 742 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  23.56 
 
 		 608 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  22.83 
 
 		 695 aa  59.7  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  22.05 
 
 		 703 aa  58.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  23.97 
 
 		 612 aa  58.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  24.35 
 
 		 607 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  24.35 
 
 		 607 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  24.35 
 
 		 812 aa  57.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  24.35 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.26 
 
 		 695 aa  56.6  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  24.81 
 
 		 608 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  23.86 
 
 		 893 aa  56.6  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  24.44 
 
 		 604 aa  55.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  22.68 
 
 		 606 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  23.35 
 
 		 606 aa  55.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  23.81 
 
 		 640 aa  55.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  20.95 
 
 		 618 aa  54.7  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  20.95 
 
 		 618 aa  54.7  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  20.95 
 
 		 618 aa  54.7  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  24.24 
 
 		 607 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  26.95 
 
 		 696 aa  52  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  23.33 
 
 		 606 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  25.27 
 
 		 657 aa  50.8  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  22.96 
 
 		 606 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  25.12 
 
 		 794 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  22.96 
 
 		 606 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  22.83 
 
 		 611 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  19.69 
 
 		 719 aa  48.9  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  23.91 
 
 		 587 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  23.87 
 
 		 699 aa  47.4  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1264 aa  47.4  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  19.17 
 
 		 797 aa  46.6  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  21.34 
 
 		 740 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  20.93 
 
 		 741 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  24.27 
 
 		 632 aa  43.9  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  18.67 
 
 		 611 aa  43.9  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  22.6 
 
 		 741 aa  43.9  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>