34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1608 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  100 
 
 		 645 aa  1288    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  89.52 
 
 		 649 aa  1133    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  99.22 
 
 		 645 aa  1278    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  34.33 
 
 		 626 aa  319  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  30.59 
 
 		 603 aa  269  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  28.84 
 
 		 630 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  28.59 
 
 		 630 aa  220  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  27.52 
 
 		 651 aa  197  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  27.69 
 
 		 608 aa  197  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  25.66 
 
 		 645 aa  157  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  24.09 
 
 		 643 aa  150  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  22.57 
 
 		 655 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  23.19 
 
 		 648 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  23.14 
 
 		 654 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  22.5 
 
 		 656 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  23.57 
 
 		 649 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  22.57 
 
 		 654 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  22.09 
 
 		 655 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  21.71 
 
 		 642 aa  100  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  24.47 
 
 		 634 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  23.8 
 
 		 632 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  23.59 
 
 		 632 aa  84  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  25.26 
 
 		 611 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  23.69 
 
 		 646 aa  81.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  23.75 
 
 		 610 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  23.71 
 
 		 580 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.99 
 
 		 709 aa  64.3  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  23.5 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  20.11 
 
 		 677 aa  55.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  21.58 
 
 		 656 aa  55.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  23.5 
 
 		 675 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  21.57 
 
 		 655 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  22.59 
 
 		 660 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  22.41 
 
 		 660 aa  43.9  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>