35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1552 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  99.22 
 
 
645 aa  1278    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  89.68 
 
 
649 aa  1139    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  100 
 
 
645 aa  1290    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  34.68 
 
 
626 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  30.92 
 
 
603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  29.3 
 
 
630 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  28.75 
 
 
630 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  28.06 
 
 
608 aa  204  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  27.68 
 
 
651 aa  203  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  25.81 
 
 
645 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  24.41 
 
 
643 aa  158  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  23.5 
 
 
648 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  22.88 
 
 
655 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  23.45 
 
 
654 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  22.82 
 
 
656 aa  137  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  23.9 
 
 
649 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  23.57 
 
 
654 aa  120  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  22.24 
 
 
655 aa  107  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  21.86 
 
 
642 aa  104  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  24.89 
 
 
634 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  24.24 
 
 
632 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  24.03 
 
 
632 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  26.1 
 
 
611 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  23.88 
 
 
646 aa  87.4  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  23.93 
 
 
610 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  23.92 
 
 
580 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.28 
 
 
709 aa  71.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  21.73 
 
 
656 aa  61.2  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  23.83 
 
 
675 aa  61.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  20.28 
 
 
677 aa  60.1  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  23.17 
 
 
615 aa  58.9  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  21.41 
 
 
655 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  21.93 
 
 
660 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  21.98 
 
 
660 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  21.72 
 
 
611 aa  47.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>