110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3951 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  71.32 
 
 		 656 aa  892    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  74.25 
 
 		 654 aa  921    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  100 
 
 		 649 aa  1284    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  73.52 
 
 		 655 aa  935    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  75.24 
 
 		 643 aa  956    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  69.97 
 
 		 645 aa  865    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  71.11 
 
 		 648 aa  884    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  33.08 
 
 		 654 aa  291  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  27.85 
 
 		 655 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  27.36 
 
 		 642 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  22.01 
 
 		 677 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  24.51 
 
 		 645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  24.03 
 
 		 649 aa  146  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  27.7 
 
 		 634 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  24.18 
 
 		 645 aa  141  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  24.48 
 
 		 709 aa  140  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  24.61 
 
 		 649 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  25.44 
 
 		 660 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  25.44 
 
 		 660 aa  133  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  29.89 
 
 		 632 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  24.09 
 
 		 603 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  24.56 
 
 		 655 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  29.54 
 
 		 632 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  24.22 
 
 		 602 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  28.42 
 
 		 610 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  25.15 
 
 		 675 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  23.06 
 
 		 630 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  22.8 
 
 		 640 aa  110  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  23.8 
 
 		 649 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  22.24 
 
 		 630 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  24.07 
 
 		 705 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  25.86 
 
 		 608 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  26.84 
 
 		 611 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  22.95 
 
 		 740 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  23.69 
 
 		 747 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  22.66 
 
 		 656 aa  95.9  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  20.29 
 
 		 626 aa  96.3  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  23.25 
 
 		 741 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  20.17 
 
 		 695 aa  90.9  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  23.79 
 
 		 646 aa  90.1  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  22.7 
 
 		 741 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  21.9 
 
 		 741 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  24.14 
 
 		 604 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  25.92 
 
 		 580 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  23.9 
 
 		 748 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  22.24 
 
 		 701 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  22.96 
 
 		 748 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  21.83 
 
 		 712 aa  77.8  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  21.74 
 
 		 732 aa  76.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  21.04 
 
 		 651 aa  76.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  22.48 
 
 		 748 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  22.19 
 
 		 699 aa  75.1  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  35.77 
 
 		 1095 aa  74.3  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  20.11 
 
 		 703 aa  70.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  22.38 
 
 		 750 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  20.13 
 
 		 606 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  23.76 
 
 		 696 aa  68.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  22.59 
 
 		 748 aa  67.8  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  20.87 
 
 		 750 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  21.68 
 
 		 606 aa  66.6  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  21.99 
 
 		 695 aa  67  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  24.77 
 
 		 682 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  23.32 
 
 		 612 aa  66.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  28.43 
 
 		 1013 aa  64.3  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1246 aa  63.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  21.9 
 
 		 745 aa  63.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  22.87 
 
 		 599 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  19.8 
 
 		 614 aa  63.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  21.04 
 
 		 614 aa  62  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  24.17 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  23.23 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  24.09 
 
 		 812 aa  60.8  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  21.38 
 
 		 606 aa  60.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  23.23 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  20.88 
 
 		 606 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  25.41 
 
 		 826 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  22.35 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  22.35 
 
 		 607 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  22.35 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  24.6 
 
 		 893 aa  57.4  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  22.35 
 
 		 608 aa  57  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  29.6 
 
 		 797 aa  57  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  29.19 
 
 		 818 aa  56.2  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  23.67 
 
 		 1077 aa  55.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  22.16 
 
 		 1278 aa  55.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  25.89 
 
 		 742 aa  55.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  27.21 
 
 		 762 aa  53.5  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  19.54 
 
 		 606 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  24.11 
 
 		 1273 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1247 aa  52.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  21.72 
 
 		 719 aa  52.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1247 aa  52  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  26.67 
 
 		 809 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  21.05 
 
 		 611 aa  51.2  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1238 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  30 
 
 		 789 aa  50.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  18.86 
 
 		 640 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  23.53 
 
 		 607 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  20.83 
 
 		 1234 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  23.59 
 
 		 632 aa  48.9  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>