45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0314 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  100 
 
 		 608 aa  1199    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  34.06 
 
 		 630 aa  319  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  33.39 
 
 		 630 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  30.53 
 
 		 651 aa  259  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  28.16 
 
 		 645 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  27.67 
 
 		 645 aa  201  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  26.05 
 
 		 649 aa  200  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  29.64 
 
 		 603 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  25.75 
 
 		 643 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  25.39 
 
 		 656 aa  111  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  25.8 
 
 		 654 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  21.78 
 
 		 626 aa  98.2  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  25.17 
 
 		 655 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  23.72 
 
 		 645 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  25.86 
 
 		 649 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  22.64 
 
 		 642 aa  88.2  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  24.29 
 
 		 677 aa  87.8  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  23.51 
 
 		 648 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  26.98 
 
 		 610 aa  84  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  23.91 
 
 		 611 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  27.81 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  29.15 
 
 		 675 aa  69.7  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  24.27 
 
 		 654 aa  69.3  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  25.55 
 
 		 660 aa  60.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  25.6 
 
 		 660 aa  60.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  24.65 
 
 		 1077 aa  60.1  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  24.12 
 
 		 655 aa  59.3  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.11 
 
 		 709 aa  57  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  26.64 
 
 		 1146 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  24.57 
 
 		 634 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1238 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  24.32 
 
 		 656 aa  50.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1234 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  24.13 
 
 		 632 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  23.92 
 
 		 646 aa  47.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  24.19 
 
 		 632 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1230 aa  45.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  23.1 
 
 		 632 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1246 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0525  protein of unknown function DUF748  23.1 
 
 		 1210 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  20.8 
 
 		 656 aa  44.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  23.39 
 
 		 1013 aa  44.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  24.8 
 
 		 667 aa  44.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0508  hypothetical protein  28.45 
 
 		 3243 aa  44.3  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  26.75 
 
 		 742 aa  43.9  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>