120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2443 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  100 
 
 		 1146 aa  2255    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1234 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1238 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1246 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1230 aa  142  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  24.2 
 
 		 1077 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  25.12 
 
 		 1273 aa  128  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  24.96 
 
 		 1278 aa  119  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  27.7 
 
 		 1331 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1247 aa  112  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1247 aa  112  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1275 aa  111  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  30.95 
 
 		 832 aa  89.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1174 aa  89.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  30.95 
 
 		 839 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  30.27 
 
 		 677 aa  84.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  32.37 
 
 		 759 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  28.04 
 
 		 1274 aa  81.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  32.37 
 
 		 818 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  37.19 
 
 		 1210 aa  81.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  32.37 
 
 		 830 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  32.37 
 
 		 830 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  32.37 
 
 		 830 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  32.37 
 
 		 830 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  32.37 
 
 		 830 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  32.37 
 
 		 824 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  32.37 
 
 		 830 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  31.21 
 
 		 764 aa  79  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  24.03 
 
 		 1273 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  22.8 
 
 		 1239 aa  77.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  30.64 
 
 		 765 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  30.64 
 
 		 765 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  30.64 
 
 		 765 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  22.09 
 
 		 1308 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  23.24 
 
 		 1186 aa  73.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  34.29 
 
 		 810 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  32.32 
 
 		 895 aa  72  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  30.99 
 
 		 782 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  30.08 
 
 		 688 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  26.01 
 
 		 765 aa  65.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  25.43 
 
 		 765 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  26.14 
 
 		 688 aa  62  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  34.71 
 
 		 709 aa  61.6  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  21.68 
 
 		 1258 aa  60.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  25 
 
 		 677 aa  60.1  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  26.2 
 
 		 1013 aa  60.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  29.11 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  25.62 
 
 		 632 aa  57.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1175 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  29.55 
 
 		 732 aa  57.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  34.71 
 
 		 1179 aa  58.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1175 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  30.43 
 
 		 735 aa  57  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  29.51 
 
 		 697 aa  57  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  26.45 
 
 		 862 aa  55.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  29.57 
 
 		 669 aa  56.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  30.58 
 
 		 680 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  28.78 
 
 		 703 aa  56.2  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  25.53 
 
 		 688 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  21.31 
 
 		 643 aa  55.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  30.43 
 
 		 791 aa  55.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  24.33 
 
 		 506 aa  55.5  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  25.53 
 
 		 688 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  27.46 
 
 		 667 aa  55.1  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  24.05 
 
 		 742 aa  55.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  29.63 
 
 		 695 aa  55.1  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  27.65 
 
 		 606 aa  54.7  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  28.78 
 
 		 689 aa  54.7  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  27.83 
 
 		 689 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  24.05 
 
 		 739 aa  54.3  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  26.25 
 
 		 656 aa  53.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  25.3 
 
 		 999 aa  53.5  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  24.05 
 
 		 745 aa  53.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  24.04 
 
 		 729 aa  53.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  24.82 
 
 		 688 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  27.07 
 
 		 745 aa  53.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  28.15 
 
 		 695 aa  53.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  23.3 
 
 		 606 aa  52.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  24.24 
 
 		 797 aa  52.4  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  27.95 
 
 		 765 aa  52.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  21.41 
 
 		 649 aa  52.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  27.4 
 
 		 608 aa  52  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  23.27 
 
 		 688 aa  52  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  26.71 
 
 		 654 aa  51.6  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  22.42 
 
 		 812 aa  51.6  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  24.89 
 
 		 656 aa  51.6  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  29.58 
 
 		 587 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  30.19 
 
 		 712 aa  50.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  27.95 
 
 		 765 aa  50.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  22.78 
 
 		 691 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  22.78 
 
 		 691 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  23.93 
 
 		 691 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  22.78 
 
 		 686 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  25.69 
 
 		 696 aa  49.7  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  22.78 
 
 		 686 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  22.78 
 
 		 686 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  22.78 
 
 		 691 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  22.78 
 
 		 686 aa  49.7  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  23.26 
 
 		 669 aa  49.3  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  20.47 
 
 		 606 aa  49.3  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>