41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2055 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1158    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  28.93 
 
 		 862 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  26 
 
 		 699 aa  63.5  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  26.99 
 
 		 919 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  30.47 
 
 		 709 aa  60.8  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  24 
 
 		 695 aa  60.5  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.03 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  25.48 
 
 		 884 aa  57  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  20.86 
 
 		 762 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  26.51 
 
 		 1038 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  21.75 
 
 		 809 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  22.22 
 
 		 1077 aa  52  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  22.93 
 
 		 607 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  22.93 
 
 		 607 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  29.17 
 
 		 656 aa  51.2  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  29.25 
 
 		 797 aa  51.2  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  23.86 
 
 		 695 aa  50.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0955  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1040 aa  50.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  22.44 
 
 		 607 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  24 
 
 		 931 aa  50.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  22.44 
 
 		 607 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  27.83 
 
 		 812 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  25.6 
 
 		 614 aa  47.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  26.59 
 
 		 677 aa  47.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  21.66 
 
 		 1079 aa  47.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  24.84 
 
 		 606 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  23.22 
 
 		 355 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1027 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4318  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1268 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.939284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0837  protein of unknown function DUF748  25.12 
 
 		 1266 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457856  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1369 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2832  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1135 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4010  hypothetical protein  23.97 
 
 		 832 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.865765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  20.21 
 
 		 1031 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  24.41 
 
 		 611 aa  44.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  24.07 
 
 		 611 aa  44.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  21.08 
 
 		 1278 aa  44.3  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  26.12 
 
 		 732 aa  43.9  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0225  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1261 aa  43.9  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.290808  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1563  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1087 aa  43.9  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.332771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  28.21 
 
 		 606 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>