125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3293 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  100 
 
 		 656 aa  1304    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  38.51 
 
 		 674 aa  409  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  35.95 
 
 		 667 aa  389  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  37.11 
 
 		 657 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  32.1 
 
 		 669 aa  319  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  31.8 
 
 		 649 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  33.76 
 
 		 632 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  30.1 
 
 		 765 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  30.13 
 
 		 765 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  30.52 
 
 		 740 aa  296  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  30.47 
 
 		 669 aa  290  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  31.11 
 
 		 688 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  29.96 
 
 		 688 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  31.11 
 
 		 688 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  32.55 
 
 		 677 aa  287  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  30.43 
 
 		 670 aa  286  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  30.96 
 
 		 688 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  29.67 
 
 		 689 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  29.18 
 
 		 678 aa  284  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  30.15 
 
 		 689 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  30.83 
 
 		 688 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  29.46 
 
 		 688 aa  281  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  30.09 
 
 		 791 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  29.19 
 
 		 735 aa  278  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  28.74 
 
 		 686 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  28.74 
 
 		 691 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  28.74 
 
 		 691 aa  271  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  28.74 
 
 		 691 aa  271  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  28.89 
 
 		 686 aa  271  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  28.74 
 
 		 686 aa  270  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  28.74 
 
 		 686 aa  270  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  30.11 
 
 		 664 aa  270  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  28.74 
 
 		 686 aa  269  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  31.65 
 
 		 762 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  29 
 
 		 691 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  30.57 
 
 		 669 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  29.05 
 
 		 686 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  29.2 
 
 		 686 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  29.2 
 
 		 686 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  29.2 
 
 		 686 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  29.2 
 
 		 686 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  29.2 
 
 		 686 aa  259  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  27.37 
 
 		 739 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  28.33 
 
 		 680 aa  248  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  27.21 
 
 		 729 aa  244  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  32.57 
 
 		 810 aa  243  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  32.14 
 
 		 782 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  32.05 
 
 		 745 aa  233  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  32.2 
 
 		 830 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  32.2 
 
 		 830 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  32.2 
 
 		 830 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  32.2 
 
 		 830 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  32.2 
 
 		 830 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  32.2 
 
 		 824 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  32.2 
 
 		 830 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  30.77 
 
 		 761 aa  231  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  31.67 
 
 		 832 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  31.68 
 
 		 839 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  32.61 
 
 		 759 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  32.33 
 
 		 764 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  32.61 
 
 		 765 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  32.61 
 
 		 765 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  32.61 
 
 		 765 aa  221  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  30.63 
 
 		 697 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  31.89 
 
 		 818 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  31.68 
 
 		 765 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  31.25 
 
 		 765 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  29.04 
 
 		 791 aa  206  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  24.56 
 
 		 710 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  24.5 
 
 		 700 aa  165  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  23.46 
 
 		 704 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  27.4 
 
 		 342 aa  87  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  24.16 
 
 		 665 aa  77.4  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  21.14 
 
 		 737 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  20.52 
 
 		 614 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  22.2 
 
 		 606 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.87 
 
 		 709 aa  72.8  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  22.56 
 
 		 646 aa  71.6  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  21.73 
 
 		 677 aa  69.3  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  25.26 
 
 		 1061 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  22.33 
 
 		 895 aa  67.8  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  22.65 
 
 		 656 aa  64.3  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  24.23 
 
 		 1061 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  22.56 
 
 		 587 aa  62.4  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  20.93 
 
 		 606 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  22.27 
 
 		 660 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  21.62 
 
 		 660 aa  58.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  23 
 
 		 1080 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  32.03 
 
 		 732 aa  57.8  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  19.94 
 
 		 606 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  19.94 
 
 		 606 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  21.71 
 
 		 712 aa  55.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  20.83 
 
 		 675 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  30.89 
 
 		 812 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  21.55 
 
 		 699 aa  52.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  21.86 
 
 		 607 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  27.41 
 
 		 630 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  25.71 
 
 		 1104 aa  51.6  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  24.88 
 
 		 1146 aa  50.8  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1234 aa  50.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>