167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2006 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  100 
 
 		 660 aa  1256    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  99.09 
 
 		 660 aa  1246    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  78.33 
 
 		 675 aa  976    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  36.73 
 
 		 656 aa  354  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  32.03 
 
 		 646 aa  297  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  29.24 
 
 		 677 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  28.5 
 
 		 709 aa  176  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  29.71 
 
 		 696 aa  160  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  27.77 
 
 		 732 aa  147  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  23.42 
 
 		 695 aa  144  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  26.38 
 
 		 742 aa  140  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  25.57 
 
 		 699 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  22.25 
 
 		 695 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  25.04 
 
 		 645 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  26.8 
 
 		 712 aa  134  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  24.92 
 
 		 606 aa  134  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  25.67 
 
 		 643 aa  134  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  25.32 
 
 		 656 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  25.19 
 
 		 606 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  26.22 
 
 		 655 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.9 
 
 		 606 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  31.27 
 
 		 705 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  33.33 
 
 		 655 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  25.04 
 
 		 606 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  25.75 
 
 		 606 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  24.2 
 
 		 614 aa  127  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  22.64 
 
 		 703 aa  127  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  25.68 
 
 		 654 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  24.6 
 
 		 648 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  28.87 
 
 		 654 aa  125  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  23.74 
 
 		 607 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  31.29 
 
 		 608 aa  123  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  28.81 
 
 		 649 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  30.86 
 
 		 640 aa  122  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  24.92 
 
 		 649 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  24.04 
 
 		 611 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  25.65 
 
 		 649 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  28.85 
 
 		 1013 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  23.27 
 
 		 612 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  27.78 
 
 		 602 aa  111  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  23.15 
 
 		 604 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  30.31 
 
 		 893 aa  106  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  30.83 
 
 		 607 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  30.83 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  26.37 
 
 		 682 aa  104  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  27.88 
 
 		 640 aa  104  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  25.23 
 
 		 606 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  26.28 
 
 		 797 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  22.07 
 
 		 614 aa  100  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  25.24 
 
 		 632 aa  98.6  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  31.56 
 
 		 607 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  25.48 
 
 		 812 aa  96.3  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  25.26 
 
 		 711 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  21.31 
 
 		 719 aa  83.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  25 
 
 		 657 aa  81.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  22.02 
 
 		 611 aa  79.7  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  26.09 
 
 		 704 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  23.24 
 
 		 670 aa  78.6  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  28.92 
 
 		 669 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  25.82 
 
 		 826 aa  76.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  21.42 
 
 		 618 aa  74.7  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  21.42 
 
 		 618 aa  74.7  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  21.42 
 
 		 618 aa  74.7  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  23.6 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  31.82 
 
 		 599 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  30.73 
 
 		 611 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  25.27 
 
 		 655 aa  72.4  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  23.55 
 
 		 740 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  27.71 
 
 		 609 aa  70.5  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  22.45 
 
 		 667 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  25.42 
 
 		 794 aa  69.3  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  24.05 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  29.08 
 
 		 587 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  29.8 
 
 		 1077 aa  64.7  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  21.94 
 
 		 656 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  27.46 
 
 		 634 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  22.73 
 
 		 649 aa  61.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  27.81 
 
 		 737 aa  60.8  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  23.86 
 
 		 669 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  22.6 
 
 		 686 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  22.6 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  22.6 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  22.6 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  22.46 
 
 		 691 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  22.46 
 
 		 691 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  22.46 
 
 		 691 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  29.44 
 
 		 725 aa  58.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  25.09 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  26.29 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  23.06 
 
 		 615 aa  57  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  22.68 
 
 		 482 aa  57  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  22.46 
 
 		 686 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  25.24 
 
 		 762 aa  56.2  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  25.2 
 
 		 608 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  23.81 
 
 		 678 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1217 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  22.12 
 
 		 618 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  25.8 
 
 		 748 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  29.75 
 
 		 604 aa  54.3  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  27.85 
 
 		 611 aa  54.3  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>