88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4058 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  98.66 
 
 		 739 aa  1394    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  50.81 
 
 		 689 aa  740    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  48.34 
 
 		 686 aa  705    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  47.37 
 
 		 680 aa  658    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  48.13 
 
 		 688 aa  710    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  50.27 
 
 		 689 aa  736    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  100 
 
 		 745 aa  1513    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  49.4 
 
 		 686 aa  737    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  49.4 
 
 		 686 aa  736    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  60.03 
 
 		 678 aa  885    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  93.96 
 
 		 729 aa  1348    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  48.93 
 
 		 688 aa  709    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  49.4 
 
 		 691 aa  738    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  49.4 
 
 		 691 aa  738    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  49.4 
 
 		 686 aa  736    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  48.13 
 
 		 688 aa  702    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  49.4 
 
 		 686 aa  737    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  48.87 
 
 		 686 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  48.87 
 
 		 686 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  48.48 
 
 		 686 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  48.48 
 
 		 686 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  48.87 
 
 		 686 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  49.27 
 
 		 686 aa  736    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  46.46 
 
 		 677 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  49.4 
 
 		 691 aa  738    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  48.66 
 
 		 688 aa  713    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  47.59 
 
 		 688 aa  684    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  47.46 
 
 		 688 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  50.13 
 
 		 691 aa  700    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  40.61 
 
 		 832 aa  598  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  41.72 
 
 		 782 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  41.5 
 
 		 810 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  41.5 
 
 		 759 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  40.13 
 
 		 765 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  40.13 
 
 		 765 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  39.3 
 
 		 765 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  40.72 
 
 		 764 aa  558  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  39.58 
 
 		 765 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  39.5 
 
 		 765 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  39.64 
 
 		 765 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  40.67 
 
 		 735 aa  541  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  40.25 
 
 		 791 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  37.78 
 
 		 740 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  49.15 
 
 		 830 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  49.15 
 
 		 830 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  49.15 
 
 		 830 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  49.15 
 
 		 830 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  49.15 
 
 		 830 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  49.15 
 
 		 830 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  49.15 
 
 		 824 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  49.47 
 
 		 839 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  48.4 
 
 		 818 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  47.13 
 
 		 669 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  39.26 
 
 		 762 aa  341  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  42.04 
 
 		 761 aa  337  7e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  39.62 
 
 		 791 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  36.82 
 
 		 632 aa  326  9e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  36.27 
 
 		 669 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  36.11 
 
 		 657 aa  280  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  34.55 
 
 		 669 aa  280  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  35.9 
 
 		 664 aa  279  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  34.03 
 
 		 670 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  27.26 
 
 		 656 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  30.82 
 
 		 667 aa  253  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  28.53 
 
 		 649 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  29.9 
 
 		 697 aa  209  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  28.37 
 
 		 700 aa  161  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  26.92 
 
 		 710 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  26.86 
 
 		 674 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  34.11 
 
 		 765 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  23.33 
 
 		 704 aa  102  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  22.19 
 
 		 1061 aa  57.4  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  22.16 
 
 		 587 aa  56.2  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  22.34 
 
 		 1061 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  25.64 
 
 		 295 aa  52  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  29.81 
 
 		 818 aa  52  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  26.97 
 
 		 797 aa  51.6  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  29.38 
 
 		 725 aa  50.8  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  22.39 
 
 		 794 aa  50.8  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  22.67 
 
 		 606 aa  50.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  31.71 
 
 		 342 aa  49.3  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  25.34 
 
 		 895 aa  49.3  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  26.8 
 
 		 1079 aa  48.1  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  20.68 
 
 		 711 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  24.63 
 
 		 1146 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  23.17 
 
 		 737 aa  45.8  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  26.34 
 
 		 608 aa  45.8  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  22.42 
 
 		 609 aa  45.8  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>