124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_02380 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  51.09 
 
 		 691 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  51.09 
 
 		 691 aa  677    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  61.26 
 
 		 688 aa  841    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  58.13 
 
 		 688 aa  783    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  57.83 
 
 		 688 aa  796    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  51.3 
 
 		 686 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  60.18 
 
 		 691 aa  785    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  100 
 
 		 677 aa  1333    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  58.77 
 
 		 689 aa  776    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  51.09 
 
 		 686 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  51.45 
 
 		 686 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  49.64 
 
 		 686 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  62.67 
 
 		 680 aa  801    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  61.55 
 
 		 688 aa  844    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  59.21 
 
 		 689 aa  781    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  51.45 
 
 		 686 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  51.09 
 
 		 686 aa  677    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  50.94 
 
 		 686 aa  674    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  53.74 
 
 		 678 aa  728    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  51.01 
 
 		 686 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  46.92 
 
 		 729 aa  638    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  61.11 
 
 		 688 aa  834    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  46.63 
 
 		 739 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  51.09 
 
 		 691 aa  677    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  50.8 
 
 		 686 aa  675    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  60.96 
 
 		 688 aa  813    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  51.09 
 
 		 686 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  51.45 
 
 		 686 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  43.72 
 
 		 765 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  43 
 
 		 765 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  43.42 
 
 		 782 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  43.88 
 
 		 740 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  45.8 
 
 		 735 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  45.42 
 
 		 791 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  44.29 
 
 		 669 aa  538  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  53.42 
 
 		 745 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  52.37 
 
 		 832 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  51.4 
 
 		 830 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  51.4 
 
 		 830 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  51.4 
 
 		 830 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  51.4 
 
 		 830 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  51.4 
 
 		 830 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  51.4 
 
 		 824 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  51.4 
 
 		 830 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  50.86 
 
 		 839 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  50.32 
 
 		 765 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  50.32 
 
 		 765 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  50.76 
 
 		 759 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  50.32 
 
 		 765 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  50.65 
 
 		 764 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  50.54 
 
 		 818 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  50.32 
 
 		 765 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  48.33 
 
 		 810 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  49.89 
 
 		 765 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  35.78 
 
 		 669 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  40.64 
 
 		 762 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  40.61 
 
 		 761 aa  369  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  39.36 
 
 		 791 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  33.33 
 
 		 632 aa  342  9e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  30.48 
 
 		 667 aa  323  6e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  32.82 
 
 		 657 aa  315  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  32.03 
 
 		 670 aa  314  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  34.26 
 
 		 669 aa  313  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  31.32 
 
 		 664 aa  299  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  32.55 
 
 		 656 aa  276  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  31.78 
 
 		 697 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  28.85 
 
 		 649 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  26.47 
 
 		 674 aa  188  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  25.04 
 
 		 710 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  25.07 
 
 		 700 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  25.13 
 
 		 704 aa  134  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  25.04 
 
 		 737 aa  77  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  23.74 
 
 		 742 aa  74.3  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  21.99 
 
 		 614 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  20.38 
 
 		 665 aa  73.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  27.11 
 
 		 342 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  27.47 
 
 		 1077 aa  69.3  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  21.48 
 
 		 604 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  24.64 
 
 		 895 aa  67.8  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  26.57 
 
 		 794 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  24.93 
 
 		 587 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  22.75 
 
 		 712 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  23.34 
 
 		 656 aa  64.3  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  26.79 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  31.03 
 
 		 675 aa  58.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  22.3 
 
 		 750 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  25 
 
 		 1146 aa  56.2  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  30.53 
 
 		 789 aa  55.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  21.87 
 
 		 741 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  22 
 
 		 750 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  20.54 
 
 		 609 aa  54.3  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  24.07 
 
 		 893 aa  54.3  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  27.27 
 
 		 797 aa  53.9  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  25.71 
 
 		 506 aa  53.5  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  20.3 
 
 		 606 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  26.8 
 
 		 701 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  31.15 
 
 		 725 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  20.57 
 
 		 614 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  23.27 
 
 		 295 aa  52  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  30.97 
 
 		 818 aa  51.2  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>