111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0077 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  100 
 
 		 506 aa  1014    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  27.79 
 
 		 893 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  30.88 
 
 		 826 aa  97.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  37.28 
 
 		 712 aa  90.9  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  25 
 
 		 604 aa  88.6  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  42.11 
 
 		 742 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  30.15 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  30.11 
 
 		 606 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  27.81 
 
 		 606 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  29.69 
 
 		 614 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  29.05 
 
 		 606 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  24.31 
 
 		 789 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  28.19 
 
 		 606 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  22.85 
 
 		 794 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  27.57 
 
 		 611 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  22.33 
 
 		 812 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  22.67 
 
 		 611 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  28.19 
 
 		 606 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  33.04 
 
 		 608 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  23.77 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  30.71 
 
 		 607 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  28.89 
 
 		 748 aa  70.5  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  31.11 
 
 		 797 aa  70.1  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  28.21 
 
 		 612 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.16 
 
 		 606 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  26.63 
 
 		 701 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  28.99 
 
 		 688 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  25.98 
 
 		 741 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  25.57 
 
 		 607 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  31.25 
 
 		 732 aa  68.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  29.92 
 
 		 607 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  29.92 
 
 		 607 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  35.92 
 
 		 748 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  35.92 
 
 		 748 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  22.76 
 
 		 611 aa  68.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  35.92 
 
 		 747 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  35.92 
 
 		 741 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  34.71 
 
 		 745 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  34.95 
 
 		 741 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  34.95 
 
 		 748 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  24.07 
 
 		 750 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1080 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  33.98 
 
 		 740 aa  62  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  28.57 
 
 		 703 aa  61.6  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  23.78 
 
 		 750 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  23.4 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  28.89 
 
 		 695 aa  60.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  22.35 
 
 		 617 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  22.35 
 
 		 617 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  22.35 
 
 		 617 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  22.35 
 
 		 617 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  22.35 
 
 		 617 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  22.35 
 
 		 617 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  22.35 
 
 		 617 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  22.35 
 
 		 617 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  30 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  22.22 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  33.88 
 
 		 725 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  32.26 
 
 		 640 aa  57.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  27.89 
 
 		 688 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  21.59 
 
 		 617 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  22.22 
 
 		 618 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  26.11 
 
 		 1061 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  22.22 
 
 		 618 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  20.18 
 
 		 618 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  22.22 
 
 		 618 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  22.22 
 
 		 618 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  29.14 
 
 		 1094 aa  53.5  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  25.71 
 
 		 677 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  27.98 
 
 		 667 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  23.39 
 
 		 604 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  30.91 
 
 		 719 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  29.46 
 
 		 711 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  24 
 
 		 632 aa  51.2  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  21.89 
 
 		 1077 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  22.01 
 
 		 759 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  24.09 
 
 		 1146 aa  50.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  22.31 
 
 		 810 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  29.79 
 
 		 677 aa  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  22.42 
 
 		 765 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  22.42 
 
 		 765 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  27.78 
 
 		 609 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  22.42 
 
 		 765 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  31.31 
 
 		 1061 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  20.11 
 
 		 618 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  20.11 
 
 		 618 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  25.71 
 
 		 688 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  20.11 
 
 		 618 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  24.02 
 
 		 688 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  19.41 
 
 		 615 aa  48.5  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  23.72 
 
 		 689 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0931  hypothetical protein  24.55 
 
 		 513 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  25.68 
 
 		 1079 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  26.76 
 
 		 1070 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  27.38 
 
 		 895 aa  47.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  24.02 
 
 		 688 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0961  hypothetical protein  24.55 
 
 		 513 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  21.21 
 
 		 764 aa  47.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  32.47 
 
 		 265 aa  47.4  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  23.53 
 
 		 689 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>