39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0931 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0961  hypothetical protein  98.44 
 
 
513 aa  992    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0931  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1010    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  22.74 
 
 
508 aa  68.2  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  22.54 
 
 
502 aa  66.6  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  28.57 
 
 
640 aa  65.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.93 
 
 
695 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  21.24 
 
 
696 aa  54.7  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  21.61 
 
 
695 aa  54.7  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  24.55 
 
 
506 aa  53.9  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  22.16 
 
 
701 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  25.48 
 
 
609 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  24.37 
 
 
741 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  19.62 
 
 
732 aa  51.6  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  21.24 
 
 
741 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  27.27 
 
 
748 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  27.27 
 
 
748 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  24.62 
 
 
747 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  16.88 
 
 
742 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  26.97 
 
 
748 aa  48.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  24 
 
 
606 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  27.47 
 
 
741 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  20.08 
 
 
712 aa  47.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  22.03 
 
 
606 aa  47  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  22.41 
 
 
604 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  19.59 
 
 
1186 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  21.03 
 
 
893 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  25.66 
 
 
606 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  20.78 
 
 
699 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  25.66 
 
 
606 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  25.66 
 
 
606 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  21.05 
 
 
612 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  20.24 
 
 
812 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  25.96 
 
 
1146 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  25 
 
 
611 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  18.18 
 
 
703 aa  44.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  23.62 
 
 
614 aa  44.3  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  21.68 
 
 
797 aa  44.3  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  25.62 
 
 
748 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  19.86 
 
 
640 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>