37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0961 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0961  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1009    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0931  hypothetical protein  98.44 
 
 		 513 aa  992    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  22.93 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  22.74 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  28.57 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.93 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  21.35 
 
 		 695 aa  54.7  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  24.55 
 
 		 506 aa  53.5  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  21.24 
 
 		 696 aa  52.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  22.16 
 
 		 701 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  25.37 
 
 		 747 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  25.48 
 
 		 609 aa  52  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  23.17 
 
 		 741 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  16.77 
 
 		 742 aa  50.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  27.27 
 
 		 748 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  19.31 
 
 		 732 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  27.27 
 
 		 748 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  20.8 
 
 		 741 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  26.97 
 
 		 748 aa  48.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  27.47 
 
 		 741 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  20.46 
 
 		 712 aa  47.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  21.4 
 
 		 893 aa  47.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  24.44 
 
 		 606 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  22.41 
 
 		 604 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1146 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  25.66 
 
 		 606 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  20.65 
 
 		 812 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  25.66 
 
 		 606 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  25 
 
 		 611 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  25.66 
 
 		 606 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  20.78 
 
 		 699 aa  44.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  22.45 
 
 		 612 aa  44.3  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  25.62 
 
 		 748 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  21.59 
 
 		 606 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  23.62 
 
 		 614 aa  44.3  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  21.68 
 
 		 797 aa  43.9  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  19.07 
 
 		 1186 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>