134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4921 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  89.85 
 
 		 748 aa  1335    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  68.94 
 
 		 741 aa  1040    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  69.34 
 
 		 741 aa  1040    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  69.67 
 
 		 740 aa  1050    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  62.22 
 
 		 750 aa  883    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  62.28 
 
 		 741 aa  915    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  90.55 
 
 		 748 aa  1340    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  63.47 
 
 		 748 aa  920    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  62.37 
 
 		 750 aa  882    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  90.79 
 
 		 748 aa  1344    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  100 
 
 		 747 aa  1504    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  29.66 
 
 		 741 aa  297  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  29.83 
 
 		 789 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  28.94 
 
 		 745 aa  279  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  30.16 
 
 		 712 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  30.47 
 
 		 699 aa  271  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  26.2 
 
 		 812 aa  226  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  27.45 
 
 		 742 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  25.52 
 
 		 797 aa  208  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  26.68 
 
 		 682 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  23.9 
 
 		 732 aa  171  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  25.8 
 
 		 711 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  23.94 
 
 		 725 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  24.08 
 
 		 893 aa  122  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  23.24 
 
 		 709 aa  120  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  24.79 
 
 		 794 aa  120  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  24.94 
 
 		 703 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1428  hypothetical protein  21.82 
 
 		 711 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  21.01 
 
 		 606 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  23.53 
 
 		 502 aa  107  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  23.53 
 
 		 508 aa  106  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  25.23 
 
 		 614 aa  106  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  22.87 
 
 		 695 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  25.33 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  23.15 
 
 		 677 aa  102  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  24.96 
 
 		 704 aa  101  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  25.13 
 
 		 607 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  25.9 
 
 		 607 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  23.17 
 
 		 611 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.56 
 
 		 606 aa  99.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  22.35 
 
 		 614 aa  98.6  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  21.12 
 
 		 695 aa  98.2  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  22.7 
 
 		 719 aa  97.8  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  25.07 
 
 		 607 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  24.89 
 
 		 696 aa  97.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  25.38 
 
 		 607 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  23.7 
 
 		 606 aa  95.1  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  23.38 
 
 		 606 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  25.48 
 
 		 608 aa  92.8  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  25.13 
 
 		 611 aa  93.2  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  22.46 
 
 		 656 aa  92  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  21.82 
 
 		 643 aa  90.9  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  24.03 
 
 		 606 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  23.37 
 
 		 606 aa  90.1  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  23.92 
 
 		 701 aa  89  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  28.29 
 
 		 826 aa  88.6  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  21.7 
 
 		 762 aa  87.4  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  29.37 
 
 		 604 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  24.02 
 
 		 640 aa  74.7  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1955  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1070 aa  74.7  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574298  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  27.87 
 
 		 609 aa  73.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  23.72 
 
 		 649 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  27.09 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  22.59 
 
 		 618 aa  70.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  22.59 
 
 		 618 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  22.59 
 
 		 618 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  22.34 
 
 		 618 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  34.09 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  22.34 
 
 		 618 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  23.85 
 
 		 645 aa  67.8  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2178  AsmA family protein  24.82 
 
 		 695 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  19.91 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  23.76 
 
 		 611 aa  63.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  21.37 
 
 		 617 aa  62.4  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  23.09 
 
 		 654 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  22.43 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  21.12 
 
 		 617 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  21.12 
 
 		 617 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  21.12 
 
 		 617 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  24.48 
 
 		 611 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  21.12 
 
 		 617 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  21.12 
 
 		 617 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  21.12 
 
 		 617 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  21.12 
 
 		 617 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  25.3 
 
 		 737 aa  59.7  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  24.33 
 
 		 649 aa  58.5  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  20.92 
 
 		 617 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  22.92 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  22.92 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  22.92 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  24.06 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0854  AsmA family protein  24.84 
 
 		 715 aa  57.4  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000187162  hitchhiker  0.00000372454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  25.09 
 
 		 649 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  24.1 
 
 		 1070 aa  55.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  26.4 
 
 		 1104 aa  53.9  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1095 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0961  hypothetical protein  25.32 
 
 		 513 aa  51.6  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  25.29 
 
 		 655 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  25.64 
 
 		 640 aa  51.6  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  23.23 
 
 		 691 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>