140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0711 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  100 
 
 		 609 aa  1223    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  56.36 
 
 		 295 aa  340  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  45.24 
 
 		 265 aa  209  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  24.83 
 
 		 587 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  30.61 
 
 		 737 aa  84  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  31.65 
 
 		 611 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  25.1 
 
 		 818 aa  80.9  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  30.2 
 
 		 704 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  33.8 
 
 		 606 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  36.11 
 
 		 677 aa  79.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  33.85 
 
 		 604 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  29.75 
 
 		 695 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  30.06 
 
 		 612 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  26.91 
 
 		 895 aa  73.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  29.41 
 
 		 695 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  26.32 
 
 		 712 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  30.36 
 
 		 812 aa  72  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  28.25 
 
 		 797 aa  71.2  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  26.11 
 
 		 701 aa  70.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  23.56 
 
 		 670 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  28.74 
 
 		 703 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  33.55 
 
 		 606 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  27.73 
 
 		 614 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  26.34 
 
 		 745 aa  67.4  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  31.1 
 
 		 606 aa  67  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  27.11 
 
 		 747 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  26.28 
 
 		 742 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  33.11 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  33.11 
 
 		 606 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  29.49 
 
 		 794 aa  65.1  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  33.77 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  26.49 
 
 		 699 aa  64.3  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  28.31 
 
 		 750 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  27.03 
 
 		 826 aa  64.3  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  27.39 
 
 		 664 aa  63.9  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  32.61 
 
 		 660 aa  63.9  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  26.36 
 
 		 719 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  27.61 
 
 		 740 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  31.88 
 
 		 660 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  31.25 
 
 		 607 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  30.47 
 
 		 608 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  22.38 
 
 		 669 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  23.26 
 
 		 782 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  27.22 
 
 		 748 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  31.25 
 
 		 607 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  21.85 
 
 		 688 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  26.55 
 
 		 725 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  30.67 
 
 		 675 aa  61.6  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  31.25 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  31.25 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  28.48 
 
 		 682 aa  60.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  25.45 
 
 		 640 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  26.42 
 
 		 732 aa  60.1  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  25.31 
 
 		 741 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  27.59 
 
 		 711 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  25.51 
 
 		 688 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  28.48 
 
 		 741 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  24.52 
 
 		 688 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  24.86 
 
 		 1077 aa  59.3  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  25.95 
 
 		 748 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  22.16 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  22.16 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  27.85 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  23.13 
 
 		 709 aa  57.8  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  22.19 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  29.2 
 
 		 762 aa  56.6  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  22.98 
 
 		 657 aa  57  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  25.32 
 
 		 748 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  23 
 
 		 632 aa  55.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  25.89 
 
 		 748 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  22.81 
 
 		 646 aa  54.7  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  29.91 
 
 		 669 aa  54.3  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  19.79 
 
 		 789 aa  53.9  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  27.27 
 
 		 697 aa  53.9  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  28.09 
 
 		 691 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  28.09 
 
 		 691 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  28.09 
 
 		 686 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  26.83 
 
 		 667 aa  53.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  24.57 
 
 		 893 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  28.09 
 
 		 686 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  28.09 
 
 		 686 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  28.09 
 
 		 691 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  28.09 
 
 		 686 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  28.09 
 
 		 686 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  27.48 
 
 		 508 aa  52.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  27.48 
 
 		 502 aa  52.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  22.83 
 
 		 604 aa  52.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  27.93 
 
 		 810 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  22.02 
 
 		 599 aa  51.2  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  25.29 
 
 		 689 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  21.95 
 
 		 791 aa  50.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  20.54 
 
 		 677 aa  50.4  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  27.78 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  28.65 
 
 		 614 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  24.89 
 
 		 761 aa  50.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  25 
 
 		 689 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  23.7 
 
 		 643 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  27.36 
 
 		 750 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  22.22 
 
 		 618 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  22.22 
 
 		 618 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>