147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1134 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  99.6 
 
 
502 aa  998    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  100 
 
 
508 aa  1014    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  27.86 
 
 
797 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  24.58 
 
 
614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  29.63 
 
 
812 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  26.54 
 
 
607 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  26.81 
 
 
607 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  26.69 
 
 
712 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  26.5 
 
 
607 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  26.5 
 
 
607 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  26.6 
 
 
612 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  25.99 
 
 
614 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  25.27 
 
 
741 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  25.48 
 
 
789 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  29.08 
 
 
794 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  25.9 
 
 
604 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  25.55 
 
 
606 aa  107  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  23.96 
 
 
742 aa  106  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  24.46 
 
 
741 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  26.09 
 
 
740 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  26.12 
 
 
606 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  27.42 
 
 
695 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  24.38 
 
 
748 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  28.29 
 
 
606 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  26.73 
 
 
606 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  28.37 
 
 
640 aa  103  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  22.07 
 
 
696 aa  103  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  26.03 
 
 
606 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  26.13 
 
 
741 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  25.83 
 
 
750 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  24 
 
 
741 aa  100  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  23.1 
 
 
747 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  24.3 
 
 
748 aa  100  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  28.57 
 
 
606 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  25.51 
 
 
750 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  24.1 
 
 
748 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  28.69 
 
 
695 aa  98.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  24.1 
 
 
748 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  25.95 
 
 
703 aa  96.7  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  24.33 
 
 
608 aa  95.9  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  22.02 
 
 
699 aa  94.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  23.93 
 
 
611 aa  94  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  24.53 
 
 
732 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  26.52 
 
 
893 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  38.74 
 
 
711 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  28.91 
 
 
677 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  31.78 
 
 
725 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  22.32 
 
 
745 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  22.96 
 
 
646 aa  75.5  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  26.92 
 
 
709 aa  73.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  29.31 
 
 
719 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  23.86 
 
 
762 aa  70.5  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  23.7 
 
 
611 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  24.03 
 
 
701 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  24.32 
 
 
611 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  29.76 
 
 
682 aa  67  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  25.41 
 
 
599 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  26.47 
 
 
656 aa  66.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  26.07 
 
 
618 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  26.07 
 
 
618 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  26.07 
 
 
618 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0961  hypothetical protein  22.93 
 
 
513 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0931  hypothetical protein  22.74 
 
 
513 aa  63.9  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  30.7 
 
 
632 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  21.72 
 
 
482 aa  62.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  28.68 
 
 
1077 aa  60.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  22.44 
 
 
655 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  23.23 
 
 
649 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  22 
 
 
645 aa  60.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  23.77 
 
 
602 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  32.67 
 
 
265 aa  58.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  22.8 
 
 
826 aa  57.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  25.13 
 
 
705 aa  57  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  24.55 
 
 
656 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  22.03 
 
 
611 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  26.98 
 
 
599 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  24.39 
 
 
1095 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  21.79 
 
 
675 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  26.98 
 
 
604 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  28.46 
 
 
862 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  20.15 
 
 
649 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  24.15 
 
 
680 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  32 
 
 
737 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  20.55 
 
 
654 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  23.23 
 
 
640 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  27.48 
 
 
609 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  23.39 
 
 
791 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  24.41 
 
 
649 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  20.14 
 
 
587 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  24.04 
 
 
660 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  22.69 
 
 
643 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  24.04 
 
 
660 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  24.65 
 
 
765 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  23.61 
 
 
1013 aa  50.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  21.84 
 
 
656 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  22.22 
 
 
1080 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  24.88 
 
 
700 aa  49.3  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  24.65 
 
 
765 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  22.37 
 
 
648 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  22.54 
 
 
740 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0128597 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>