87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1137 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  100 
 
 		 265 aa  527  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  45.08 
 
 		 609 aa  222  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  27.27 
 
 		 587 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  32.53 
 
 		 797 aa  82  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  32.59 
 
 		 677 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  26.88 
 
 		 704 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  22.67 
 
 		 646 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  28.38 
 
 		 1077 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  28.03 
 
 		 737 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  33.55 
 
 		 612 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  33.86 
 
 		 695 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  31.93 
 
 		 660 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  31.93 
 
 		 660 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  34.04 
 
 		 664 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  27.4 
 
 		 812 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  32.63 
 
 		 657 aa  65.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  31.93 
 
 		 745 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  39.77 
 
 		 604 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  34.43 
 
 		 725 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  28.41 
 
 		 611 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  32.61 
 
 		 712 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  36 
 
 		 695 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  28.17 
 
 		 701 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  39.08 
 
 		 606 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  30.77 
 
 		 675 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  25.73 
 
 		 794 aa  62.4  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  25.68 
 
 		 789 aa  62  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  27.11 
 
 		 632 aa  62  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  25.47 
 
 		 742 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  27.97 
 
 		 732 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  26.87 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  32.67 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  26.97 
 
 		 640 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  32.67 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  31.73 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  29.57 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  31 
 
 		 703 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  33.33 
 
 		 669 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  29.31 
 
 		 667 aa  56.2  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  24.18 
 
 		 607 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  34.44 
 
 		 606 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  24.18 
 
 		 607 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  30.83 
 
 		 614 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  24.18 
 
 		 607 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  24.18 
 
 		 607 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  25.16 
 
 		 818 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  29.6 
 
 		 606 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  35.29 
 
 		 606 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  35.29 
 
 		 614 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  31.76 
 
 		 608 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  30 
 
 		 670 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  30.93 
 
 		 606 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  30.93 
 
 		 606 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  21.79 
 
 		 709 aa  52.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  27.84 
 
 		 697 aa  52.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  29.36 
 
 		 688 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  21.54 
 
 		 696 aa  52.4  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  26.67 
 
 		 711 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  22.56 
 
 		 699 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  28.57 
 
 		 665 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  36.54 
 
 		 682 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  23.46 
 
 		 895 aa  49.7  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  25.99 
 
 		 892 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  30.43 
 
 		 691 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  24.44 
 
 		 748 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  26.39 
 
 		 750 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  23.58 
 
 		 1146 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  35.82 
 
 		 688 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  32.47 
 
 		 506 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  24.44 
 
 		 748 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1344  hypothetical protein  24.84 
 
 		 776 aa  47.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  22.96 
 
 		 748 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  22.22 
 
 		 656 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  30 
 
 		 750 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  26.26 
 
 		 604 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  23.13 
 
 		 747 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  27.5 
 
 		 741 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  27.84 
 
 		 599 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  24.29 
 
 		 740 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  25.93 
 
 		 748 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1217 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  26.23 
 
 		 826 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  23.21 
 
 		 615 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  26.26 
 
 		 611 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  26.26 
 
 		 611 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  27.86 
 
 		 656 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  22.15 
 
 		 862 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>