47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0212 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  100 
 
 		 1217 aa  2383    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  41.83 
 
 		 1191 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  31.67 
 
 		 1095 aa  354  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1955  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1070 aa  228  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574298  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  29.78 
 
 		 699 aa  108  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  24.79 
 
 		 797 aa  94.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  23.73 
 
 		 812 aa  89.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  25.5 
 
 		 711 aa  89  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  21.68 
 
 		 893 aa  84.7  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  25.13 
 
 		 682 aa  83.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  24.94 
 
 		 712 aa  82  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  24.84 
 
 		 742 aa  70.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  22.92 
 
 		 741 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  24.56 
 
 		 725 aa  64.3  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  23.91 
 
 		 741 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  24.68 
 
 		 741 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.5 
 
 		 695 aa  62.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  21.99 
 
 		 695 aa  62  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  25 
 
 		 794 aa  59.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  25.09 
 
 		 660 aa  57.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  25.99 
 
 		 696 aa  57  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  24.17 
 
 		 677 aa  57  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  25.65 
 
 		 660 aa  56.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  23.42 
 
 		 748 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  25.33 
 
 		 750 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  23.28 
 
 		 748 aa  55.1  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  24.54 
 
 		 750 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  24.2 
 
 		 611 aa  54.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  28.21 
 
 		 675 aa  54.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  31.78 
 
 		 1077 aa  52.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  23.66 
 
 		 732 aa  52  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  22.89 
 
 		 748 aa  51.6  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  22.89 
 
 		 748 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  19.26 
 
 		 614 aa  50.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  24.24 
 
 		 762 aa  50.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  24.55 
 
 		 747 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  23.51 
 
 		 587 aa  50.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  25.45 
 
 		 646 aa  49.3  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  20.92 
 
 		 640 aa  48.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  23.56 
 
 		 701 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  25.57 
 
 		 709 aa  47.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  26.44 
 
 		 649 aa  48.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  21.51 
 
 		 703 aa  48.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  21.92 
 
 		 606 aa  47  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  20.69 
 
 		 740 aa  47.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  25 
 
 		 895 aa  45.4  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  26.1 
 
 		 826 aa  45.1  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>