44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1659 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  100 
 
 		 1191 aa  2336    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  41.83 
 
 		 1217 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  33.17 
 
 		 1095 aa  346  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1955  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1070 aa  189  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574298  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  25.52 
 
 		 893 aa  92.8  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  24.62 
 
 		 699 aa  91.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  23.47 
 
 		 712 aa  79.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  26.15 
 
 		 742 aa  74.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  21.27 
 
 		 812 aa  71.6  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  23.53 
 
 		 797 aa  70.1  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  24.06 
 
 		 677 aa  65.1  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  24.94 
 
 		 696 aa  63.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  20.99 
 
 		 741 aa  61.6  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  22.34 
 
 		 711 aa  60.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  22.83 
 
 		 682 aa  56.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  24.07 
 
 		 606 aa  55.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  27.16 
 
 		 701 aa  54.7  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  24.91 
 
 		 604 aa  53.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  25.34 
 
 		 826 aa  53.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  21.2 
 
 		 695 aa  52.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  20.93 
 
 		 703 aa  51.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  23.36 
 
 		 614 aa  51.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  26.12 
 
 		 649 aa  50.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  23.39 
 
 		 599 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  34.21 
 
 		 789 aa  49.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  25 
 
 		 646 aa  48.5  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  20.69 
 
 		 607 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  20.07 
 
 		 695 aa  48.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  26.39 
 
 		 741 aa  47.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  20.34 
 
 		 607 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  21.99 
 
 		 612 aa  47  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  20.69 
 
 		 607 aa  46.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  21.99 
 
 		 611 aa  46.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  23.03 
 
 		 587 aa  46.2  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  20.83 
 
 		 794 aa  45.8  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  20.36 
 
 		 640 aa  45.8  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  20.33 
 
 		 762 aa  45.8  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  25.31 
 
 		 640 aa  45.8  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  22.6 
 
 		 748 aa  45.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  40.74 
 
 		 660 aa  45.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  23.33 
 
 		 732 aa  45.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.41 
 
 		 709 aa  45.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  40.74 
 
 		 660 aa  45.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2054  AsmA  27.91 
 
 		 878 aa  44.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.588924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>