69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1682 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  100 
 
 		 1095 aa  2168    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  33.17 
 
 		 1191 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  31.67 
 
 		 1217 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1955  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1070 aa  158  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574298  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  28.57 
 
 		 699 aa  115  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  24.93 
 
 		 711 aa  95.1  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  26.86 
 
 		 696 aa  93.6  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  22.8 
 
 		 812 aa  92.4  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  23.93 
 
 		 712 aa  90.5  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  24.92 
 
 		 893 aa  87  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  25.38 
 
 		 794 aa  86.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  24.57 
 
 		 742 aa  84.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  25.3 
 
 		 797 aa  79.3  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  23.48 
 
 		 701 aa  78.2  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  25.22 
 
 		 682 aa  75.9  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  25.78 
 
 		 789 aa  74.3  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  35.48 
 
 		 649 aa  68.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  24.43 
 
 		 732 aa  63.9  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  24.15 
 
 		 611 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  27.17 
 
 		 656 aa  58.5  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  22.62 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  26.67 
 
 		 643 aa  57.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  22.09 
 
 		 695 aa  57  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  20.5 
 
 		 640 aa  57.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  28.08 
 
 		 655 aa  56.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  24.39 
 
 		 508 aa  55.5  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  31.43 
 
 		 648 aa  55.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  24.39 
 
 		 502 aa  55.5  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  26.17 
 
 		 1013 aa  55.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  20.74 
 
 		 703 aa  54.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  23.55 
 
 		 741 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  19.18 
 
 		 719 aa  53.5  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.33 
 
 		 606 aa  53.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  23.85 
 
 		 725 aa  53.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  20.75 
 
 		 1080 aa  52.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1428  hypothetical protein  21.8 
 
 		 711 aa  52.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  22.86 
 
 		 747 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  26.01 
 
 		 614 aa  52.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  23.92 
 
 		 608 aa  51.6  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1785  hypothetical protein  34.43 
 
 		 470 aa  51.6  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  30.88 
 
 		 645 aa  51.2  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  24.91 
 
 		 606 aa  50.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  25.11 
 
 		 646 aa  51.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  27.16 
 
 		 611 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  28.78 
 
 		 654 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  23.2 
 
 		 748 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  23.2 
 
 		 748 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  34.48 
 
 		 1294 aa  49.7  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  27.78 
 
 		 660 aa  48.9  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  23.65 
 
 		 606 aa  48.9  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  22.18 
 
 		 745 aa  48.5  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  28.89 
 
 		 649 aa  48.5  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  27.78 
 
 		 660 aa  48.5  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  25 
 
 		 656 aa  48.5  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  22.18 
 
 		 700 aa  48.9  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  23.2 
 
 		 748 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  23.53 
 
 		 1272 aa  48.1  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  25 
 
 		 1238 aa  48.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1234 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  32.76 
 
 		 1331 aa  47  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  20.89 
 
 		 1234 aa  46.2  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  25 
 
 		 669 aa  46.2  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  32.38 
 
 		 818 aa  46.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  23.01 
 
 		 611 aa  46.2  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  25.14 
 
 		 677 aa  46.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  21.64 
 
 		 741 aa  46.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  22.85 
 
 		 606 aa  45.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  31.76 
 
 		 675 aa  45.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  25.95 
 
 		 630 aa  44.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>