74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1428 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1428  hypothetical protein  100 
 
 		 711 aa  1412    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  22.47 
 
 		 747 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  22.4 
 
 		 750 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  21.41 
 
 		 740 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  20.55 
 
 		 750 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  21.28 
 
 		 748 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  24.63 
 
 		 741 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  21.56 
 
 		 748 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  22.45 
 
 		 748 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  21 
 
 		 732 aa  107  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  21.38 
 
 		 748 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  21.53 
 
 		 741 aa  102  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  21.66 
 
 		 741 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  22.77 
 
 		 607 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  23.09 
 
 		 607 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  23.73 
 
 		 606 aa  92.8  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  21.09 
 
 		 741 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  22.93 
 
 		 607 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  22.66 
 
 		 607 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  23.16 
 
 		 612 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.71 
 
 		 606 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  22.42 
 
 		 606 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  21.9 
 
 		 742 aa  78.2  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  22.11 
 
 		 606 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  22.11 
 
 		 606 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  23.63 
 
 		 611 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.2 
 
 		 695 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  21.43 
 
 		 699 aa  74.3  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  23.06 
 
 		 614 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  21.28 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  20.25 
 
 		 695 aa  72  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  21.13 
 
 		 797 aa  71.6  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  21.07 
 
 		 604 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  21.97 
 
 		 701 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  20.08 
 
 		 789 aa  67  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  23.79 
 
 		 704 aa  65.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  21.81 
 
 		 606 aa  62.4  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  22.75 
 
 		 762 aa  62  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  24.47 
 
 		 712 aa  60.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  33.04 
 
 		 745 aa  58.9  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  21.07 
 
 		 719 aa  57  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  37.21 
 
 		 640 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  20.05 
 
 		 646 aa  56.2  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  22.56 
 
 		 608 aa  55.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  28.7 
 
 		 618 aa  54.3  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  28.7 
 
 		 618 aa  54.3  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  28.7 
 
 		 618 aa  54.3  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  22.5 
 
 		 618 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  26.98 
 
 		 615 aa  53.5  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  22.5 
 
 		 618 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  20.53 
 
 		 703 aa  53.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  22.27 
 
 		 618 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1095 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  22.27 
 
 		 618 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  27.83 
 
 		 617 aa  52  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  27.83 
 
 		 617 aa  52  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  27.83 
 
 		 617 aa  52  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  27.83 
 
 		 617 aa  52  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  27.83 
 
 		 617 aa  52  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  27.83 
 
 		 617 aa  52  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  27.83 
 
 		 617 aa  52  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  27.83 
 
 		 617 aa  52  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  27.83 
 
 		 617 aa  52  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  26.54 
 
 		 893 aa  51.2  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  26.09 
 
 		 611 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  26.09 
 
 		 618 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  27.68 
 
 		 506 aa  48.9  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  29.41 
 
 		 611 aa  48.9  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  27.03 
 
 		 599 aa  48.5  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  24.44 
 
 		 604 aa  48.9  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  21.39 
 
 		 812 aa  48.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  26.09 
 
 		 611 aa  47.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  18.69 
 
 		 1191 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  23.48 
 
 		 711 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>