122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1016 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1016  AsmA  100 
 
 		 656 aa  1257    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  35.5 
 
 		 660 aa  350  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  35.66 
 
 		 660 aa  349  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  35.25 
 
 		 675 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  29.82 
 
 		 646 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  24.93 
 
 		 677 aa  155  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  26.4 
 
 		 709 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  23.94 
 
 		 611 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  26.09 
 
 		 742 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  23.05 
 
 		 606 aa  124  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  24.52 
 
 		 604 aa  122  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  23.42 
 
 		 614 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  22.88 
 
 		 607 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  22.95 
 
 		 606 aa  108  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  23 
 
 		 606 aa  107  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  23.42 
 
 		 614 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  23.68 
 
 		 606 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  26.32 
 
 		 712 aa  104  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  25.72 
 
 		 606 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  24.43 
 
 		 705 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  25 
 
 		 606 aa  100  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  29.6 
 
 		 602 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  26.67 
 
 		 893 aa  98.2  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  28.63 
 
 		 640 aa  95.1  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  29.55 
 
 		 655 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  22.5 
 
 		 649 aa  93.2  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  23.32 
 
 		 612 aa  93.6  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  24.89 
 
 		 699 aa  91.3  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  28.17 
 
 		 797 aa  90.5  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  27.55 
 
 		 649 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  26.52 
 
 		 607 aa  87  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  22.14 
 
 		 649 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  26.52 
 
 		 607 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  28.33 
 
 		 732 aa  86.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  28.84 
 
 		 607 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  25.99 
 
 		 654 aa  85.5  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  21.61 
 
 		 648 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  25.89 
 
 		 608 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  22.79 
 
 		 645 aa  83.2  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  19.34 
 
 		 695 aa  82  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  26.15 
 
 		 695 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  23.81 
 
 		 812 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  23.36 
 
 		 1013 aa  78.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  24.88 
 
 		 632 aa  75.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  20.93 
 
 		 655 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  22.35 
 
 		 656 aa  74.3  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  25.52 
 
 		 611 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  25.5 
 
 		 642 aa  73.9  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  22.8 
 
 		 667 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  22.05 
 
 		 643 aa  73.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  26.53 
 
 		 640 aa  73.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  25.4 
 
 		 599 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  24.57 
 
 		 670 aa  71.2  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  22.65 
 
 		 656 aa  71.2  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  26.82 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  24.19 
 
 		 697 aa  70.1  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  26.82 
 
 		 502 aa  70.5  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  21.94 
 
 		 654 aa  68.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  25.16 
 
 		 1077 aa  68.2  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  22.24 
 
 		 649 aa  67.8  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  23 
 
 		 677 aa  67.4  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  23.32 
 
 		 664 aa  67  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  23.61 
 
 		 703 aa  66.6  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  23.71 
 
 		 669 aa  66.6  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  20.76 
 
 		 688 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  21.24 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  27.97 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  27.98 
 
 		 794 aa  63.9  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  23.15 
 
 		 700 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  21.06 
 
 		 686 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  23.12 
 
 		 704 aa  62  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  20.38 
 
 		 688 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  21.06 
 
 		 686 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  21.06 
 
 		 686 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  21.06 
 
 		 686 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  21.06 
 
 		 686 aa  61.6  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  21.06 
 
 		 691 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  21.06 
 
 		 691 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  20.43 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  29.08 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  21.06 
 
 		 691 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  23.22 
 
 		 655 aa  60.1  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  22.71 
 
 		 691 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  21.81 
 
 		 719 aa  58.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  21.74 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  25.61 
 
 		 826 aa  58.2  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  22.76 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  22.15 
 
 		 657 aa  57.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  25.19 
 
 		 789 aa  57.4  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  23.41 
 
 		 669 aa  57  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  24.63 
 
 		 688 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  20.93 
 
 		 686 aa  55.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  22.42 
 
 		 688 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  22.33 
 
 		 680 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  20.79 
 
 		 649 aa  54.7  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  21.58 
 
 		 645 aa  52.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  33.33 
 
 		 737 aa  52  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1238 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1234 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  24.81 
 
 		 725 aa  51.2  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>