166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2657 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  100 
 
 		 737 aa  1395    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  29.35 
 
 		 704 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  25.23 
 
 		 632 aa  127  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  23.59 
 
 		 667 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  25.28 
 
 		 657 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  24.69 
 
 		 664 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  32.09 
 
 		 1077 aa  106  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  26.88 
 
 		 669 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  22.13 
 
 		 670 aa  102  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  30.27 
 
 		 295 aa  100  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  24.84 
 
 		 649 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  24.44 
 
 		 678 aa  99.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  25.5 
 
 		 677 aa  96.3  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  22.81 
 
 		 656 aa  93.2  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  22.77 
 
 		 688 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  36.45 
 
 		 797 aa  89.7  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  23.02 
 
 		 669 aa  88.6  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  24.14 
 
 		 762 aa  89  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  31.76 
 
 		 609 aa  87  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  25.83 
 
 		 646 aa  86.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  25.25 
 
 		 689 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  24.82 
 
 		 689 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  25.83 
 
 		 747 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  24.42 
 
 		 688 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  24.83 
 
 		 765 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  33.33 
 
 		 742 aa  82  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  24.32 
 
 		 688 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  23.84 
 
 		 688 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  29.09 
 
 		 895 aa  82  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  23.34 
 
 		 691 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  32.35 
 
 		 789 aa  80.9  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  22.72 
 
 		 688 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  26.95 
 
 		 265 aa  80.1  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  25.45 
 
 		 695 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  22.92 
 
 		 669 aa  78.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  35.42 
 
 		 732 aa  78.6  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  24.04 
 
 		 765 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  23.75 
 
 		 740 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  22.71 
 
 		 686 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  22.71 
 
 		 691 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  22.71 
 
 		 691 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  22.71 
 
 		 691 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  22.71 
 
 		 686 aa  76.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  21.76 
 
 		 712 aa  76.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  22.71 
 
 		 686 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  22.71 
 
 		 686 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  22.71 
 
 		 686 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  25.3 
 
 		 748 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  25.23 
 
 		 695 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  23.15 
 
 		 710 aa  75.1  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  28.51 
 
 		 660 aa  75.1  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  23.22 
 
 		 688 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  24.42 
 
 		 699 aa  73.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  24.83 
 
 		 741 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  24.92 
 
 		 677 aa  73.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  24.14 
 
 		 761 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  23.66 
 
 		 719 aa  73.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  26.06 
 
 		 700 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  34.25 
 
 		 696 aa  72.8  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  27.63 
 
 		 675 aa  73.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  28.51 
 
 		 660 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  24.74 
 
 		 748 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  23.82 
 
 		 791 aa  71.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  26.71 
 
 		 606 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  24.97 
 
 		 680 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  24.39 
 
 		 748 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  22.96 
 
 		 665 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  29.46 
 
 		 1278 aa  68.9  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 812 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  29.3 
 
 		 725 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  27.39 
 
 		 606 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  30 
 
 		 794 aa  67  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  29.58 
 
 		 740 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  28.97 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  27.06 
 
 		 606 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  24.14 
 
 		 741 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  25.68 
 
 		 502 aa  63.5  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  27.17 
 
 		 482 aa  63.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  25.68 
 
 		 508 aa  63.9  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  22.29 
 
 		 686 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  25.25 
 
 		 762 aa  62.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  25.06 
 
 		 614 aa  63.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  27.27 
 
 		 587 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  25.22 
 
 		 741 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  22.75 
 
 		 674 aa  62.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  28.64 
 
 		 607 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  29.35 
 
 		 607 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  29.35 
 
 		 607 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  26.8 
 
 		 741 aa  61.6  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  22 
 
 		 686 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  25.8 
 
 		 709 aa  61.6  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  23.57 
 
 		 832 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  22.14 
 
 		 686 aa  61.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  29.72 
 
 		 604 aa  61.2  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1247 aa  60.8  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  22.14 
 
 		 686 aa  60.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  28.23 
 
 		 818 aa  60.8  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  22.14 
 
 		 686 aa  60.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  24.43 
 
 		 748 aa  60.8  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  23.57 
 
 		 839 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>