92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1745 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  963    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1785  hypothetical protein  22.73 
 
 		 470 aa  113  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  25.88 
 
 		 712 aa  81.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  26.7 
 
 		 789 aa  80.9  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  26.7 
 
 		 812 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  28.85 
 
 		 742 aa  77.4  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  29.63 
 
 		 699 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  26.06 
 
 		 748 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  27.32 
 
 		 682 aa  70.5  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  27.66 
 
 		 747 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  29.71 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  25.82 
 
 		 741 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  26.63 
 
 		 748 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  26.52 
 
 		 741 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  27.17 
 
 		 748 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  25.14 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  23.53 
 
 		 750 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  26.05 
 
 		 612 aa  65.1  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  36.07 
 
 		 606 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  26.92 
 
 		 765 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  26.92 
 
 		 765 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  30.52 
 
 		 794 aa  63.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  21.72 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  24.34 
 
 		 748 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  24.48 
 
 		 839 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  24.86 
 
 		 740 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  23.94 
 
 		 502 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  25.13 
 
 		 711 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  23.59 
 
 		 732 aa  61.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  25.71 
 
 		 606 aa  60.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  21.94 
 
 		 797 aa  60.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  23.96 
 
 		 832 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  23.2 
 
 		 695 aa  60.1  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  26.14 
 
 		 607 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  26.14 
 
 		 607 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  26.14 
 
 		 607 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  20.43 
 
 		 632 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.32 
 
 		 695 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  26.14 
 
 		 607 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  22.99 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  26.96 
 
 		 745 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  23.5 
 
 		 606 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  29.73 
 
 		 791 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  24.54 
 
 		 611 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  22.64 
 
 		 604 aa  57  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  24.31 
 
 		 740 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  26.04 
 
 		 759 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  21.99 
 
 		 660 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  21.99 
 
 		 660 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  28 
 
 		 725 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  24.54 
 
 		 741 aa  55.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  30.33 
 
 		 735 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  26.96 
 
 		 719 aa  54.3  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  30.97 
 
 		 614 aa  53.5  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  21.22 
 
 		 1077 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0854  AsmA family protein  26.43 
 
 		 715 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000187162  hitchhiker  0.00000372454 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  21.94 
 
 		 893 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  24.22 
 
 		 704 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  30.97 
 
 		 737 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  26.04 
 
 		 830 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  25.6 
 
 		 762 aa  52.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  26.04 
 
 		 830 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  26.04 
 
 		 830 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  26.04 
 
 		 824 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  26.04 
 
 		 830 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  26.04 
 
 		 830 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  26.04 
 
 		 830 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  23.31 
 
 		 677 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  29.06 
 
 		 703 aa  50.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  33.71 
 
 		 606 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.97 
 
 		 709 aa  50.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  26.36 
 
 		 810 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  25.32 
 
 		 640 aa  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  25.52 
 
 		 765 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  24.21 
 
 		 765 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  24.21 
 
 		 765 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  21.05 
 
 		 696 aa  48.9  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  24.21 
 
 		 765 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2223  protein of unknown function DUF748  27.27 
 
 		 1216 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.023159  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  25.48 
 
 		 606 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  20.74 
 
 		 677 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  25.48 
 
 		 606 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  22.92 
 
 		 764 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  23.96 
 
 		 818 aa  47.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  34.04 
 
 		 608 aa  47.4  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  23.03 
 
 		 669 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  27.14 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  27.43 
 
 		 667 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  22.49 
 
 		 680 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  24.48 
 
 		 765 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  22.29 
 
 		 587 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  25 
 
 		 656 aa  43.9  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>