60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0854 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0854  AsmA family protein  100 
 
 		 715 aa  1403    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000187162  hitchhiker  0.00000372454 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0916  AsmA family protein  23.5 
 
 		 767 aa  186  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000782114  hitchhiker  1.05471e-16 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  27.32 
 
 		 893 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  21.6 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  24.66 
 
 		 712 aa  70.1  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  23.9 
 
 		 812 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  24.38 
 
 		 695 aa  64.3  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  28.09 
 
 		 611 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  24.16 
 
 		 741 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  24.79 
 
 		 711 aa  61.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  27.55 
 
 		 884 aa  60.8  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  29.27 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  25 
 
 		 747 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  24.69 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  23.03 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  25.85 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  23.46 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  22.56 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  25.85 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  26.73 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  22.55 
 
 		 695 aa  57.4  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  24.75 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  28.91 
 
 		 606 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  32.2 
 
 		 612 aa  56.6  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  24.75 
 
 		 607 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  20.69 
 
 		 696 aa  55.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  26.45 
 
 		 748 aa  56.6  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  24.75 
 
 		 607 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  20.74 
 
 		 725 aa  55.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  25.15 
 
 		 606 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  21.65 
 
 		 502 aa  53.1  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  26.43 
 
 		 482 aa  52.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  24.07 
 
 		 606 aa  53.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  22.42 
 
 		 741 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  26.02 
 
 		 703 aa  52.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  23.21 
 
 		 741 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  22.01 
 
 		 750 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  26.56 
 
 		 606 aa  52  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  22.99 
 
 		 809 aa  51.2  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  26.17 
 
 		 797 aa  51.2  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  21.34 
 
 		 508 aa  50.8  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  25 
 
 		 677 aa  50.8  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  22.46 
 
 		 742 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  20.33 
 
 		 732 aa  50.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  31.07 
 
 		 608 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  26.44 
 
 		 826 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  25.56 
 
 		 701 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  23.64 
 
 		 614 aa  50.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  27.35 
 
 		 1070 aa  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  22.77 
 
 		 794 aa  48.5  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  20.76 
 
 		 741 aa  48.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  23.32 
 
 		 609 aa  48.5  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1344  hypothetical protein  23.02 
 
 		 776 aa  47  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  20.31 
 
 		 750 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  22.95 
 
 		 719 aa  46.6  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  27.34 
 
 		 506 aa  45.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  23.72 
 
 		 611 aa  45.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  24.24 
 
 		 604 aa  44.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  24.52 
 
 		 745 aa  44.3  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  26.67 
 
 		 1061 aa  44.3  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>