127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_67975 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  62.65 
 
 		 748 aa  908    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  62.82 
 
 		 741 aa  924    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  64.01 
 
 		 741 aa  938    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  62.98 
 
 		 740 aa  934    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  61.68 
 
 		 748 aa  895    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  100 
 
 		 750 aa  1501    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  63.91 
 
 		 741 aa  944    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  63.47 
 
 		 748 aa  914    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  97.47 
 
 		 750 aa  1389    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  63.37 
 
 		 748 aa  915    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  62.48 
 
 		 747 aa  908    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  28.42 
 
 		 745 aa  280  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  28.94 
 
 		 789 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  29.23 
 
 		 741 aa  271  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  30.42 
 
 		 699 aa  257  6e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  29.57 
 
 		 712 aa  256  9e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  27.5 
 
 		 682 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  25.72 
 
 		 742 aa  191  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  24.54 
 
 		 794 aa  183  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  25 
 
 		 812 aa  182  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  24.7 
 
 		 732 aa  173  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  24.24 
 
 		 711 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  25.22 
 
 		 725 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  26.51 
 
 		 797 aa  140  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  23.8 
 
 		 703 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  22.37 
 
 		 677 aa  120  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  23.77 
 
 		 893 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  24.78 
 
 		 709 aa  116  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  23.84 
 
 		 701 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  22.07 
 
 		 695 aa  114  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1428  hypothetical protein  21.07 
 
 		 711 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  26.09 
 
 		 502 aa  111  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  23.26 
 
 		 719 aa  109  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  25.83 
 
 		 508 aa  109  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.68 
 
 		 695 aa  107  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  27.08 
 
 		 604 aa  104  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  23.24 
 
 		 611 aa  101  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  25.6 
 
 		 614 aa  100  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  27.78 
 
 		 696 aa  100  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  25.45 
 
 		 606 aa  97.4  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.72 
 
 		 606 aa  90.9  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  26.45 
 
 		 608 aa  89  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  23.69 
 
 		 606 aa  88.6  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  26.89 
 
 		 612 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  24.29 
 
 		 606 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  25.62 
 
 		 606 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  25.62 
 
 		 606 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  20.7 
 
 		 762 aa  80.1  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  28.04 
 
 		 826 aa  78.2  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  22.57 
 
 		 607 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  25.18 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  23.51 
 
 		 607 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  22.78 
 
 		 607 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  23.12 
 
 		 614 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  22.86 
 
 		 607 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  22.11 
 
 		 656 aa  74.3  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  24.4 
 
 		 482 aa  70.1  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  21.54 
 
 		 643 aa  69.3  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  27.37 
 
 		 609 aa  68.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  23.91 
 
 		 506 aa  66.6  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  22.76 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  22.38 
 
 		 677 aa  63.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2178  AsmA family protein  24.54 
 
 		 695 aa  61.6  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1955  hypothetical protein  20.06 
 
 		 1070 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  22.54 
 
 		 645 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  23.36 
 
 		 618 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  23.36 
 
 		 618 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  23.36 
 
 		 618 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  26.05 
 
 		 704 aa  59.7  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  24.76 
 
 		 611 aa  59.7  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  27.78 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  24.84 
 
 		 649 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  24.79 
 
 		 640 aa  59.3  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  21.79 
 
 		 649 aa  59.3  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  23.6 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  21.49 
 
 		 618 aa  57.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  21.49 
 
 		 618 aa  57.4  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  20.86 
 
 		 618 aa  57.4  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  22.73 
 
 		 649 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  21.49 
 
 		 618 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  21.22 
 
 		 618 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  25.45 
 
 		 669 aa  55.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  27.01 
 
 		 604 aa  54.7  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1217 aa  54.7  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  23.79 
 
 		 657 aa  54.3  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  26 
 
 		 1070 aa  53.9  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0854  AsmA family protein  22.02 
 
 		 715 aa  53.9  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000187162  hitchhiker  0.00000372454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  23.38 
 
 		 678 aa  53.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  25.25 
 
 		 611 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  22.54 
 
 		 735 aa  52  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  29.79 
 
 		 839 aa  50.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  23.68 
 
 		 611 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  29.5 
 
 		 832 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  18.12 
 
 		 617 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  22.97 
 
 		 892 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0916  AsmA family protein  22.83 
 
 		 767 aa  48.9  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000782114  hitchhiker  1.05471e-16 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  17.81 
 
 		 617 aa  48.9  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  30.99 
 
 		 765 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  18.12 
 
 		 617 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  30.99 
 
 		 765 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>