47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2178 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2178  AsmA family protein  100 
 
 		 695 aa  1379    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  26.95 
 
 		 711 aa  165  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  23.8 
 
 		 701 aa  124  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  25.07 
 
 		 699 aa  80.5  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  22.57 
 
 		 745 aa  74.7  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  23.59 
 
 		 742 aa  72  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  25.06 
 
 		 747 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  24.37 
 
 		 712 aa  68.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  24.16 
 
 		 748 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  24.73 
 
 		 740 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  24.37 
 
 		 750 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  24.34 
 
 		 748 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  23.96 
 
 		 812 aa  63.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  24.34 
 
 		 748 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  24.88 
 
 		 750 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  21.7 
 
 		 695 aa  59.7  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  23.31 
 
 		 732 aa  58.2  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.77 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  21.96 
 
 		 618 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  22.76 
 
 		 797 aa  50.8  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.56 
 
 		 606 aa  50.8  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  21.82 
 
 		 741 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  21.71 
 
 		 618 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.39 
 
 		 709 aa  50.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  21.73 
 
 		 618 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  27.27 
 
 		 614 aa  49.7  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  24.49 
 
 		 696 aa  49.7  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  23.51 
 
 		 704 aa  48.9  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  21.31 
 
 		 618 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  23.27 
 
 		 618 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  24.1 
 
 		 599 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  24.86 
 
 		 607 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  23.77 
 
 		 741 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  27.63 
 
 		 607 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  20.34 
 
 		 617 aa  46.2  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  21.01 
 
 		 617 aa  45.8  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  21.01 
 
 		 617 aa  45.8  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1428  hypothetical protein  20.95 
 
 		 711 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  23.05 
 
 		 741 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  20.73 
 
 		 617 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  20.73 
 
 		 617 aa  45.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  20.73 
 
 		 617 aa  45.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  20.73 
 
 		 617 aa  45.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  24.32 
 
 		 607 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  24.06 
 
 		 654 aa  44.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  24.32 
 
 		 607 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  27.64 
 
 		 634 aa  43.9  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>