152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3055 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  100 
 
 		 657 aa  1304    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  39.01 
 
 		 667 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  42.39 
 
 		 664 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  40.95 
 
 		 669 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  39.87 
 
 		 670 aa  439  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  38.85 
 
 		 632 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  38.51 
 
 		 669 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  37.11 
 
 		 656 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  36.64 
 
 		 649 aa  357  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  34.08 
 
 		 688 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  34.68 
 
 		 688 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  34.68 
 
 		 688 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  34.38 
 
 		 688 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  34.3 
 
 		 688 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  32.83 
 
 		 735 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  34.7 
 
 		 689 aa  326  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  33.59 
 
 		 688 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  32.51 
 
 		 765 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  32.88 
 
 		 677 aa  323  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  34.75 
 
 		 689 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  31.93 
 
 		 765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  31.37 
 
 		 678 aa  309  8e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  33.14 
 
 		 791 aa  309  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  33.02 
 
 		 691 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  31.91 
 
 		 740 aa  308  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  35.71 
 
 		 697 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  33.22 
 
 		 669 aa  302  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  30.58 
 
 		 686 aa  297  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  30.28 
 
 		 686 aa  297  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  30.28 
 
 		 686 aa  297  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  30.28 
 
 		 691 aa  296  7e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  30.28 
 
 		 691 aa  296  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  30.28 
 
 		 691 aa  296  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  30.28 
 
 		 686 aa  296  8e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  30.28 
 
 		 686 aa  296  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  32.28 
 
 		 680 aa  295  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  37.69 
 
 		 759 aa  293  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  36.74 
 
 		 830 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  36.74 
 
 		 830 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  37.67 
 
 		 810 aa  289  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  36.74 
 
 		 830 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  36.74 
 
 		 830 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  36.74 
 
 		 830 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  36.74 
 
 		 824 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  36.74 
 
 		 830 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  32.54 
 
 		 674 aa  288  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  29.91 
 
 		 686 aa  286  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  29.91 
 
 		 686 aa  286  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  36.6 
 
 		 764 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  29.91 
 
 		 686 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  37.31 
 
 		 782 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  29.91 
 
 		 686 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  29.91 
 
 		 686 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  37.89 
 
 		 832 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  35.24 
 
 		 762 aa  280  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  29.75 
 
 		 686 aa  280  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  36.96 
 
 		 839 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  36.17 
 
 		 765 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  35.87 
 
 		 818 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  36.17 
 
 		 765 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  36.17 
 
 		 765 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  36.6 
 
 		 765 aa  273  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  35.21 
 
 		 791 aa  270  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  35.95 
 
 		 765 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  36.87 
 
 		 729 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  36.3 
 
 		 739 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  36.3 
 
 		 745 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  54.66 
 
 		 342 aa  253  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  32.21 
 
 		 761 aa  243  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  28.62 
 
 		 710 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  27.79 
 
 		 704 aa  182  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  25.26 
 
 		 700 aa  172  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  21.53 
 
 		 677 aa  92.8  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  21.28 
 
 		 665 aa  90.1  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  24.2 
 
 		 895 aa  87  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.73 
 
 		 709 aa  86.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  25.74 
 
 		 737 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  23.51 
 
 		 742 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  22.65 
 
 		 606 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  24.81 
 
 		 660 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  26.69 
 
 		 587 aa  77.4  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  25.74 
 
 		 660 aa  77  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  24.69 
 
 		 675 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  24.42 
 
 		 1077 aa  73.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  24.91 
 
 		 794 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  27.04 
 
 		 711 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  24.29 
 
 		 646 aa  70.5  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  22.29 
 
 		 612 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  24.72 
 
 		 893 aa  66.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  32.63 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  23.91 
 
 		 699 aa  64.7  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  22.56 
 
 		 611 aa  64.3  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  20.68 
 
 		 695 aa  63.9  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  25 
 
 		 1061 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01672  AsmA family membrane protein  76.32 
 
 		 38 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.079614  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  20.15 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  22.99 
 
 		 606 aa  62  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  22.52 
 
 		 656 aa  60.5  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  21.73 
 
 		 614 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  27.89 
 
 		 818 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>