113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4857 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  53.77 
 
 		 691 aa  744    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  53.77 
 
 		 691 aa  744    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  100 
 
 		 688 aa  1382    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  61.11 
 
 		 677 aa  834    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  75.22 
 
 		 688 aa  1028    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  75.07 
 
 		 688 aa  1044    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  74.71 
 
 		 691 aa  1014    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  69.14 
 
 		 689 aa  939    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  51.82 
 
 		 686 aa  714    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  66.11 
 
 		 680 aa  889    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  46.46 
 
 		 765 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  99.13 
 
 		 688 aa  1370    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  68.56 
 
 		 689 aa  936    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  48.8 
 
 		 745 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  53.77 
 
 		 686 aa  743    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  53.62 
 
 		 686 aa  740    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  60.29 
 
 		 678 aa  816    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  46.67 
 
 		 782 aa  664    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  49.59 
 
 		 729 aa  690    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  96.22 
 
 		 688 aa  1336    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  49.19 
 
 		 739 aa  688    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  53.77 
 
 		 691 aa  744    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  53.91 
 
 		 686 aa  744    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  94.18 
 
 		 688 aa  1285    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  53.77 
 
 		 686 aa  743    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  46.74 
 
 		 765 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  54.08 
 
 		 686 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  54.08 
 
 		 686 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  54.23 
 
 		 686 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  54.08 
 
 		 686 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  54.08 
 
 		 686 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  53.77 
 
 		 686 aa  744    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  46.67 
 
 		 740 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  46.45 
 
 		 735 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  44.54 
 
 		 791 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  45.24 
 
 		 669 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  55.67 
 
 		 830 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  55.67 
 
 		 830 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  55.67 
 
 		 830 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  55.67 
 
 		 830 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  55.67 
 
 		 830 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  55.67 
 
 		 824 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  55.67 
 
 		 830 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  56.68 
 
 		 759 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  57.11 
 
 		 765 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  56.9 
 
 		 765 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  56.9 
 
 		 765 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  55.93 
 
 		 832 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  56.44 
 
 		 818 aa  512  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  53.78 
 
 		 810 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  55.6 
 
 		 764 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  56.25 
 
 		 765 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  54.66 
 
 		 839 aa  505  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  55.82 
 
 		 765 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  36.3 
 
 		 669 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  38.68 
 
 		 762 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  34.07 
 
 		 632 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  39.49 
 
 		 761 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  37.19 
 
 		 791 aa  355  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  35.32 
 
 		 669 aa  333  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  33.63 
 
 		 664 aa  327  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  30.99 
 
 		 667 aa  326  7e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  35.01 
 
 		 657 aa  323  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  32.93 
 
 		 670 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  30.96 
 
 		 656 aa  278  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  30.09 
 
 		 697 aa  264  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  29.76 
 
 		 649 aa  258  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  26.69 
 
 		 674 aa  186  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  25.75 
 
 		 710 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  25.6 
 
 		 700 aa  154  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  24.26 
 
 		 704 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  20.58 
 
 		 665 aa  94  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  27.6 
 
 		 342 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  24.45 
 
 		 895 aa  68.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  23.31 
 
 		 737 aa  67.8  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  23.12 
 
 		 742 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  24.22 
 
 		 711 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  25 
 
 		 1077 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  25.07 
 
 		 794 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  29.51 
 
 		 818 aa  64.3  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  25 
 
 		 1061 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  28.89 
 
 		 797 aa  60.1  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  22.16 
 
 		 609 aa  58.2  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  25 
 
 		 1061 aa  58.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  19.93 
 
 		 656 aa  57.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  29.45 
 
 		 745 aa  55.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  29.26 
 
 		 1094 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  22.83 
 
 		 587 aa  55.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  26.57 
 
 		 725 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  25 
 
 		 604 aa  52.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  27.27 
 
 		 712 aa  52  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  22.21 
 
 		 606 aa  52  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  25.22 
 
 		 1146 aa  51.6  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  20.5 
 
 		 893 aa  50.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  29.82 
 
 		 612 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  23.38 
 
 		 660 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  21.3 
 
 		 699 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  23.59 
 
 		 606 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  24.02 
 
 		 506 aa  48.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  23.55 
 
 		 660 aa  48.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>