81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2665 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  100 
 
 		 674 aa  1325    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  38.36 
 
 		 656 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  32.15 
 
 		 657 aa  276  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  28.62 
 
 		 667 aa  256  7e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  28.94 
 
 		 632 aa  231  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  29.1 
 
 		 669 aa  223  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  28.66 
 
 		 670 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  26.84 
 
 		 765 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  26.73 
 
 		 765 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  29.19 
 
 		 649 aa  211  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  26.38 
 
 		 688 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  28.12 
 
 		 664 aa  204  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  28.74 
 
 		 669 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  27.71 
 
 		 688 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  26.91 
 
 		 688 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  26.48 
 
 		 677 aa  196  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  26.69 
 
 		 688 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  28.77 
 
 		 669 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  25.16 
 
 		 735 aa  191  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  25.91 
 
 		 688 aa  191  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  26.48 
 
 		 688 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  26.56 
 
 		 740 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  25.93 
 
 		 689 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  26.2 
 
 		 678 aa  189  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  30.67 
 
 		 832 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  25.08 
 
 		 689 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  25.9 
 
 		 791 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  27.32 
 
 		 680 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  28.46 
 
 		 762 aa  182  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  30.67 
 
 		 839 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  29.74 
 
 		 810 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  26.44 
 
 		 686 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  30.65 
 
 		 764 aa  178  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  31.36 
 
 		 759 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  25.71 
 
 		 691 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  30.3 
 
 		 830 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  30.3 
 
 		 830 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  30.3 
 
 		 830 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  30.3 
 
 		 830 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  30.3 
 
 		 830 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  30.3 
 
 		 830 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  30.3 
 
 		 824 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  25.11 
 
 		 710 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  30.84 
 
 		 765 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  30.84 
 
 		 765 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  31.22 
 
 		 765 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  31.22 
 
 		 765 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  30.77 
 
 		 765 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  29.21 
 
 		 818 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  24.74 
 
 		 686 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  24.74 
 
 		 686 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  24.74 
 
 		 691 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  24.74 
 
 		 691 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  24.74 
 
 		 691 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  24.74 
 
 		 686 aa  167  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  24.74 
 
 		 686 aa  167  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  28.02 
 
 		 782 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  25.34 
 
 		 686 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  24.91 
 
 		 686 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  24.91 
 
 		 686 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  24.91 
 
 		 686 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  24.73 
 
 		 686 aa  160  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  24.56 
 
 		 686 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  26.24 
 
 		 791 aa  149  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  25.8 
 
 		 761 aa  148  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  25.49 
 
 		 739 aa  148  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  25.49 
 
 		 745 aa  148  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  25.49 
 
 		 729 aa  147  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  22.63 
 
 		 700 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  25.62 
 
 		 697 aa  130  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  25.66 
 
 		 704 aa  107  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  26.32 
 
 		 342 aa  76.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  21.96 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  22.74 
 
 		 737 aa  55.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  23.15 
 
 		 895 aa  50.8  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  24.46 
 
 		 711 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  24.9 
 
 		 295 aa  49.7  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  27.57 
 
 		 587 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  22.3 
 
 		 695 aa  46.6  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  22.52 
 
 		 741 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  22.36 
 
 		 745 aa  44.3  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>