122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0666 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  100 
 
 		 697 aa  1360    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  36.8 
 
 		 670 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  37.72 
 
 		 664 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  33.94 
 
 		 667 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  35.68 
 
 		 632 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  33.74 
 
 		 669 aa  365  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  32.47 
 
 		 735 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  33.65 
 
 		 669 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  35.57 
 
 		 657 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  30.22 
 
 		 765 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  30.04 
 
 		 765 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  31.22 
 
 		 791 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  30.42 
 
 		 688 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  29.64 
 
 		 688 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  32.25 
 
 		 677 aa  317  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  30.19 
 
 		 688 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  30.66 
 
 		 688 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  30.66 
 
 		 688 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  30.76 
 
 		 688 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  30.51 
 
 		 740 aa  312  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  32.54 
 
 		 669 aa  310  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  31.78 
 
 		 689 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  31.69 
 
 		 689 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  31.67 
 
 		 680 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  30.91 
 
 		 691 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  28.89 
 
 		 678 aa  292  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  29.37 
 
 		 691 aa  291  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  29.37 
 
 		 691 aa  291  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  29.37 
 
 		 686 aa  290  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  29.37 
 
 		 686 aa  291  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  29.37 
 
 		 691 aa  291  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  29.37 
 
 		 686 aa  291  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  29.37 
 
 		 686 aa  289  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  29.22 
 
 		 686 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  29.28 
 
 		 686 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  37.02 
 
 		 830 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  37.02 
 
 		 830 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  37.02 
 
 		 830 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  37.02 
 
 		 830 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  37.02 
 
 		 830 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  37.02 
 
 		 824 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  37.02 
 
 		 830 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  36.38 
 
 		 818 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  28.68 
 
 		 686 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  28.83 
 
 		 686 aa  277  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  33.6 
 
 		 782 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  28.68 
 
 		 686 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  28.68 
 
 		 686 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  28.68 
 
 		 686 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  34.56 
 
 		 839 aa  273  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  34.76 
 
 		 832 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  33.75 
 
 		 810 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  33.62 
 
 		 765 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  33.62 
 
 		 765 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  33.4 
 
 		 765 aa  269  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  34.67 
 
 		 764 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  33.83 
 
 		 759 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  31.58 
 
 		 656 aa  260  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  33.4 
 
 		 765 aa  257  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  32.98 
 
 		 765 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  31.56 
 
 		 761 aa  251  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  29.21 
 
 		 649 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  32.56 
 
 		 791 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  28.74 
 
 		 762 aa  241  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  25.54 
 
 		 729 aa  233  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  30.37 
 
 		 739 aa  229  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  30.37 
 
 		 745 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  25.36 
 
 		 710 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  27.17 
 
 		 674 aa  168  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  24.37 
 
 		 700 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  23.71 
 
 		 704 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  27.85 
 
 		 342 aa  98.2  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  23.59 
 
 		 737 aa  92  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  24.24 
 
 		 656 aa  90.1  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  19.79 
 
 		 665 aa  79  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  27.71 
 
 		 1077 aa  67.8  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  24.46 
 
 		 675 aa  67.4  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  29.77 
 
 		 609 aa  63.9  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  21.67 
 
 		 677 aa  63.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  23.08 
 
 		 587 aa  62  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  23.73 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  23.57 
 
 		 660 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  29.51 
 
 		 1146 aa  57  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  25.19 
 
 		 695 aa  55.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  29.93 
 
 		 695 aa  55.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  23.73 
 
 		 606 aa  55.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  20.98 
 
 		 614 aa  54.3  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  31.06 
 
 		 725 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  26.98 
 
 		 646 aa  53.5  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  24.79 
 
 		 612 aa  53.9  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  24.63 
 
 		 611 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  27.84 
 
 		 265 aa  52.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  30.48 
 
 		 794 aa  51.6  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  32.08 
 
 		 604 aa  50.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  23.62 
 
 		 508 aa  50.4  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  23.62 
 
 		 502 aa  50.4  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  21.81 
 
 		 741 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  33.04 
 
 		 711 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  26.47 
 
 		 703 aa  48.9  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  33.33 
 
 		 696 aa  48.5  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>