90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03372 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  49.8 
 
 		 739 aa  725    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  52.92 
 
 		 689 aa  723    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  87.76 
 
 		 686 aa  1196    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  52.42 
 
 		 680 aa  687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  53.62 
 
 		 688 aa  755    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  52.77 
 
 		 689 aa  726    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  49.4 
 
 		 745 aa  721    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  100 
 
 		 686 aa  1386    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  99.85 
 
 		 686 aa  1383    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  59.88 
 
 		 678 aa  838    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  50.34 
 
 		 729 aa  722    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  53.77 
 
 		 688 aa  753    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  100 
 
 		 691 aa  1397    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  100 
 
 		 691 aa  1397    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  99.27 
 
 		 686 aa  1377    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  54.2 
 
 		 688 aa  751    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  100 
 
 		 686 aa  1386    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  93 
 
 		 686 aa  1259    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  93.15 
 
 		 686 aa  1261    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  92.86 
 
 		 686 aa  1259    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  93.15 
 
 		 686 aa  1261    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  93.15 
 
 		 686 aa  1261    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  99.85 
 
 		 686 aa  1384    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  51.09 
 
 		 677 aa  688    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  100 
 
 		 691 aa  1397    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  53.77 
 
 		 688 aa  756    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  51.51 
 
 		 688 aa  699    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  54.31 
 
 		 691 aa  707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  50.51 
 
 		 688 aa  710    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  41.06 
 
 		 765 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  41.06 
 
 		 765 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  41.25 
 
 		 782 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  40.92 
 
 		 735 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  40.3 
 
 		 740 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  42.06 
 
 		 669 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  40.73 
 
 		 791 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  47.98 
 
 		 830 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  47.98 
 
 		 830 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  46.04 
 
 		 810 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  47.49 
 
 		 832 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  47.98 
 
 		 830 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  47.77 
 
 		 824 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  47.98 
 
 		 830 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  47.98 
 
 		 830 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  47.98 
 
 		 830 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  47.07 
 
 		 839 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  47.66 
 
 		 764 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  47.66 
 
 		 765 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  47.13 
 
 		 818 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  47.45 
 
 		 759 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  46.44 
 
 		 765 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  46.38 
 
 		 765 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  46.38 
 
 		 765 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  46.38 
 
 		 765 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  37.42 
 
 		 762 aa  395  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  40.34 
 
 		 761 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  37.38 
 
 		 791 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  34.08 
 
 		 669 aa  361  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  31.7 
 
 		 632 aa  340  7e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  30.78 
 
 		 667 aa  327  6e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  31.18 
 
 		 657 aa  296  7e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  30.8 
 
 		 670 aa  290  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  29.6 
 
 		 664 aa  283  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  29.77 
 
 		 669 aa  281  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  28.74 
 
 		 656 aa  270  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  28.99 
 
 		 697 aa  253  7e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  28.02 
 
 		 649 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  27.16 
 
 		 700 aa  169  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  24.74 
 
 		 674 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  23.16 
 
 		 710 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  22.51 
 
 		 704 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  22.59 
 
 		 587 aa  71.2  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  25.11 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  19.07 
 
 		 665 aa  61.6  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  21.06 
 
 		 656 aa  57.4  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  28.57 
 
 		 609 aa  55.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  20.49 
 
 		 895 aa  55.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  22.34 
 
 		 737 aa  55.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  25 
 
 		 732 aa  51.6  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  25.85 
 
 		 660 aa  51.6  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  26.63 
 
 		 660 aa  51.6  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  31.58 
 
 		 794 aa  50.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  21.13 
 
 		 1061 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  26.59 
 
 		 797 aa  50.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  21.38 
 
 		 818 aa  48.1  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  22.16 
 
 		 711 aa  48.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  22.68 
 
 		 1079 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  22.35 
 
 		 747 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  19.07 
 
 		 1061 aa  45.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  27.59 
 
 		 614 aa  44.3  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>