105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4747 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  59.88 
 
 		 691 aa  831    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  59.88 
 
 		 691 aa  831    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  60.29 
 
 		 688 aa  827    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  58.63 
 
 		 688 aa  792    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  57.89 
 
 		 688 aa  801    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  60.82 
 
 		 691 aa  800    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  58.36 
 
 		 689 aa  811    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  58.72 
 
 		 686 aa  807    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  54.22 
 
 		 680 aa  724    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  60 
 
 		 688 aa  823    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  58.33 
 
 		 689 aa  811    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  59.63 
 
 		 745 aa  854    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  59.88 
 
 		 686 aa  830    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  59.88 
 
 		 686 aa  828    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  100 
 
 		 678 aa  1367    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  60.71 
 
 		 729 aa  858    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  60 
 
 		 688 aa  823    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  60.3 
 
 		 739 aa  860    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  59.88 
 
 		 691 aa  831    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  59.59 
 
 		 686 aa  825    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  61.55 
 
 		 688 aa  819    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  59.88 
 
 		 686 aa  830    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  59.74 
 
 		 686 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  59.74 
 
 		 686 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  59.71 
 
 		 686 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  59.74 
 
 		 686 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  59.74 
 
 		 686 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  59.88 
 
 		 686 aa  832    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  53.74 
 
 		 677 aa  735    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  44.56 
 
 		 765 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  44.7 
 
 		 765 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  43.57 
 
 		 740 aa  586  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  42.02 
 
 		 782 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  45.85 
 
 		 669 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  43.58 
 
 		 735 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  42.35 
 
 		 791 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  51.29 
 
 		 832 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  49.58 
 
 		 810 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  49.16 
 
 		 830 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  49.16 
 
 		 830 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  50.64 
 
 		 839 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  49.16 
 
 		 830 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  49.16 
 
 		 830 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  49.16 
 
 		 830 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  49.16 
 
 		 830 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  49.16 
 
 		 824 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  48.43 
 
 		 818 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  49.35 
 
 		 759 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  48.49 
 
 		 764 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  49.14 
 
 		 765 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  48.28 
 
 		 765 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  48.28 
 
 		 765 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  48.28 
 
 		 765 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  47.43 
 
 		 765 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  39.56 
 
 		 762 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  34.72 
 
 		 632 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  34.46 
 
 		 669 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  37.6 
 
 		 791 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  38.64 
 
 		 761 aa  353  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  32.98 
 
 		 669 aa  324  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  32.14 
 
 		 670 aa  316  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  29.16 
 
 		 667 aa  307  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  31.85 
 
 		 657 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  31.33 
 
 		 664 aa  300  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  31.64 
 
 		 649 aa  290  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  29.18 
 
 		 656 aa  276  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  28.66 
 
 		 697 aa  244  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  26.47 
 
 		 674 aa  181  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  25 
 
 		 710 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  27.38 
 
 		 700 aa  169  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  24.38 
 
 		 704 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  21.09 
 
 		 665 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  24.32 
 
 		 737 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  26.26 
 
 		 587 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  24.77 
 
 		 342 aa  70.5  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  23.41 
 
 		 895 aa  65.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  26.92 
 
 		 794 aa  62  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  21.24 
 
 		 656 aa  62  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  21.34 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  26.63 
 
 		 1079 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  27.59 
 
 		 797 aa  56.6  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  20.51 
 
 		 711 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  27.32 
 
 		 1104 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  23.28 
 
 		 1061 aa  54.7  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  24.34 
 
 		 1061 aa  54.3  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  25.64 
 
 		 732 aa  51.6  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  27.08 
 
 		 725 aa  51.6  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  26.02 
 
 		 295 aa  50.8  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  23.46 
 
 		 675 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  24.46 
 
 		 606 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  22.47 
 
 		 741 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  23.7 
 
 		 1094 aa  48.5  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  24.68 
 
 		 1077 aa  47  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  21.86 
 
 		 677 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  25 
 
 		 1080 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  22.77 
 
 		 660 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  26.15 
 
 		 614 aa  45.8  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  23.63 
 
 		 611 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  26.5 
 
 		 712 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  22.77 
 
 		 660 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>