115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1371 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  48.8 
 
 		 1080 aa  1054    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  50.61 
 
 		 1079 aa  1088    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  41.84 
 
 		 1070 aa  866    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  100 
 
 		 1104 aa  2246    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  49.77 
 
 		 1061 aa  1060    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  38.86 
 
 		 1094 aa  781    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  50.87 
 
 		 1061 aa  1063    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1102 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  27.08 
 
 		 1234 aa  101  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  24.12 
 
 		 1144 aa  88.6  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  28.64 
 
 		 895 aa  70.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  21.59 
 
 		 1224 aa  63.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  22.65 
 
 		 809 aa  62  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  27.57 
 
 		 632 aa  60.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0928  hypothetical protein  26.52 
 
 		 655 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.903286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  28.09 
 
 		 748 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1341 aa  60.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  24.81 
 
 		 797 aa  60.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1398 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1398 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  27.53 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  27.53 
 
 		 748 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  22.9 
 
 		 1323 aa  57  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1390 aa  56.6  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  25.68 
 
 		 1235 aa  57  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1397 aa  57  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1399 aa  56.2  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1399 aa  56.2  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1399 aa  56.2  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1210 aa  56.2  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1436 aa  55.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1417 aa  55.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  27.32 
 
 		 678 aa  55.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1399 aa  55.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1399 aa  55.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1662  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1235 aa  55.1  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1383 aa  55.1  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  25.97 
 
 		 1304 aa  55.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1416 aa  55.1  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1417 aa  55.1  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  22.93 
 
 		 1379 aa  54.7  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1368 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1397 aa  54.3  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1288 aa  54.3  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  25.42 
 
 		 740 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1264 aa  54.3  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1397 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1397 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1397 aa  54.3  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1372 aa  54.3  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1384 aa  54.3  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1397 aa  53.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1419 aa  53.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  26.4 
 
 		 747 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  22.89 
 
 		 742 aa  53.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  25 
 
 		 1394 aa  53.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1287 aa  53.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1454 aa  53.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1459 aa  52.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1441 aa  52.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1446 aa  52.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1392 aa  52  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  25.51 
 
 		 782 aa  52  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  25.73 
 
 		 740 aa  51.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  21.71 
 
 		 699 aa  50.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  25.71 
 
 		 656 aa  51.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1040 aa  50.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  24.46 
 
 		 812 aa  50.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  23.56 
 
 		 1515 aa  50.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  24.61 
 
 		 649 aa  50.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1283 aa  50.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  23.78 
 
 		 748 aa  49.7  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1045  hypothetical protein  21.95 
 
 		 921 aa  50.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665952  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1398 aa  50.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0634  hypothetical protein  20.44 
 
 		 856 aa  49.3  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  27.1 
 
 		 741 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1400  hypothetical protein  20.44 
 
 		 843 aa  49.3  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.71275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  23.76 
 
 		 669 aa  49.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0555  hypothetical protein  20.44 
 
 		 843 aa  48.9  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0819  hypothetical protein  26.09 
 
 		 856 aa  48.9  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1273 aa  48.5  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1273 aa  48.1  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1307 aa  48.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1443 aa  48.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  23.64 
 
 		 1384 aa  47.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1305 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1357  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1025 aa  46.6  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1141 aa  47  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1307 aa  47  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1307 aa  47  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2223  protein of unknown function DUF748  23.64 
 
 		 1216 aa  47.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.023159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1290 aa  46.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  26.8 
 
 		 765 aa  46.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  24.7 
 
 		 741 aa  46.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1785  hypothetical protein  26.97 
 
 		 470 aa  46.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1266 aa  46.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  21.84 
 
 		 1301 aa  46.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1274 aa  45.8  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  26.8 
 
 		 765 aa  46.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1149 aa  45.8  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>