44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1887 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  44.09 
 
 		 1132 aa  981    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  100 
 
 		 1141 aa  2293    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  44.28 
 
 		 1133 aa  990    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  40.94 
 
 		 1128 aa  894    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  31.7 
 
 		 1146 aa  537  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1146 aa  539  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  36.01 
 
 		 1132 aa  502  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1111 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1177 aa  258  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1237 aa  249  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1210 aa  247  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1240 aa  246  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1192 aa  247  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1243 aa  240  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1240 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1255 aa  234  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1197 aa  231  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1141 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1244 aa  222  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1232 aa  218  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1169 aa  213  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1151 aa  208  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1149 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1149 aa  202  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1175 aa  197  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1088 aa  140  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1094 aa  135  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1094 aa  131  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1105 aa  127  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1162 aa  117  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1097 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1093 aa  108  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1155 aa  99.8  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  24.8 
 
 		 996 aa  76.6  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  26.8 
 
 		 995 aa  76.6  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1102 aa  76.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1024 aa  72  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  22.63 
 
 		 943 aa  68.9  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  21.49 
 
 		 1040 aa  62.4  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  23.68 
 
 		 1061 aa  53.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  24.56 
 
 		 1061 aa  52.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  25.42 
 
 		 1144 aa  49.7  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  25.44 
 
 		 1094 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  24.56 
 
 		 1104 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>