40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6053 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  100 
 
 		 1192 aa  2311    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  59.05 
 
 		 1151 aa  1248    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  58.93 
 
 		 1175 aa  1226    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  60.9 
 
 		 1149 aa  1264    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  83.42 
 
 		 1141 aa  1821    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  58.4 
 
 		 1149 aa  1263    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1240 aa  512  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1197 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1255 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1177 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1232 aa  389  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1237 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1240 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1243 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1210 aa  368  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1244 aa  360  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1133 aa  260  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1128 aa  249  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1141 aa  247  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1132 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1111 aa  243  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1146 aa  237  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1146 aa  237  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1132 aa  235  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1169 aa  201  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1088 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1162 aa  145  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1094 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1024 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1094 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1155 aa  119  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1093 aa  105  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1102 aa  102  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  23.75 
 
 		 995 aa  87  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1105 aa  84.7  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  27.91 
 
 		 943 aa  84.3  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  24.58 
 
 		 996 aa  84  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1040 aa  80.1  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  28.45 
 
 		 1144 aa  73.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  39.42 
 
 		 1097 aa  70.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>