43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1307 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  100 
 
 
1162 aa  2244    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  25.68 
 
 
1169 aa  199  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  25.23 
 
 
1094 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  25.32 
 
 
1094 aa  184  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  24.37 
 
 
1097 aa  177  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  25.27 
 
 
1088 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  25.93 
 
 
1151 aa  153  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  23.94 
 
 
1177 aa  149  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  24.75 
 
 
1175 aa  148  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  24.1 
 
 
1192 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  24.42 
 
 
1149 aa  145  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  24.93 
 
 
1141 aa  141  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  23.03 
 
 
1155 aa  139  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  23.58 
 
 
1149 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  22.35 
 
 
1132 aa  127  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  23.94 
 
 
1093 aa  127  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  22.66 
 
 
1146 aa  125  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  22.66 
 
 
1146 aa  125  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  24.31 
 
 
1105 aa  118  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  22.84 
 
 
1240 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  20.73 
 
 
1141 aa  117  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  23.04 
 
 
1133 aa  111  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  25.3 
 
 
1024 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  21.82 
 
 
1132 aa  108  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  25.07 
 
 
1128 aa  106  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  21.31 
 
 
1111 aa  103  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  22.9 
 
 
996 aa  102  4e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  32.05 
 
 
995 aa  102  5e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  23.37 
 
 
1243 aa  99  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  21.64 
 
 
1255 aa  97.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  22.55 
 
 
1210 aa  96.3  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  22.14 
 
 
1240 aa  95.9  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  21.15 
 
 
1232 aa  93.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  22.56 
 
 
1244 aa  91.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  27.12 
 
 
943 aa  91.7  8e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  22.64 
 
 
1102 aa  86.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  25.86 
 
 
1040 aa  84.7  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  31.79 
 
 
1237 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  35.34 
 
 
1197 aa  82  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  27.97 
 
 
1094 aa  52.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  23.62 
 
 
1144 aa  51.6  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  19.23 
 
 
1079 aa  50.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  26.44 
 
 
1224 aa  47  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>